新測序技術將徹底改變白血病治療
日期：2016-10-18 08:44:24
在白血病這種疾病中，每個細胞都可能表現出不同的遺傳性狀，現在，來自瑞典的研究人員已經找到了一種廉價的方法來檢測單個細胞。這一研究突破發表在10月14日的《Nature Communications》，可能徹底改變白血病的治療。
細胞內擠滿了基因信息，它們可以用來改善疾病治療，如癌癥，但今天通常使用的RNA測序方法存在一個限制：它們不能確定哪個細胞中正在發生基因活動。
最近在《Nature Communications》發表的研究中，瑞典的研究人員提出了一種新方法，他們用該方法來檢測慢性淋巴細胞白血病（CLL）患者的單個腫瘤細胞，考慮到該團隊發現白血病腫瘤是由具有完全不同的基因表達的細胞組成，這項研究結果可以說是一個重要突破。
瑞典皇家理工學院基因技術教授和生命科學實驗室基因組學平臺主任Joakim Lundeberg說：“我們發現，CLL細胞并不只包含一種單一的細胞類型，而是多個亞克隆，它們表現出完全不同的基因表達。”
通常情況下，RNA測序能夠提供有關“生物樣品中存在什么RNA分子”的信息，而不是“它們在哪里或哪個細胞內是活躍的”這樣的信息。
他說：“有了這種新的、非常符合成本效益的技術，我們現在可以對血液腫瘤樣本內的這種復雜性獲得一個全新的看法。單細胞的分子分辨率，有可能成為一種更廣泛使用的治療選擇。”
Lundeberg說，這種方法可將一個位置標簽附加到分子上，對單個細胞中所有的mRNA分子進行分析。
研究人員在一個特制的玻璃表面上對單個細胞進行分類，并用新一代測序對RNA分子進行分析，就可以確定哪些基因是活躍的。玻璃表面上的空間信息，可以告訴我們一個特定的RNA分子是在哪一個細胞內被發現的。
Lundeberg表示：“我們還開發了一個開放的、可用的軟件（www.spatialtranscriptomicsresearch.org），可將單個細胞的圖像與來自測序的信息結合起來，即，哪些基因被表達，以及在什么水平上表達。”他說：“用新的方法和軟件，我們可以在一天的時間內研究成千上萬個細胞。”
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