高產(chǎn)華人教授Cell子刊解讀癌癥與lncRNA
日期：2016-04-13 08:49:27
癌癥研究過去主要集中在基因組的編碼區(qū)域。這些研究取得了許多突破性成果，為癌癥靶向性療法奠定了基礎(chǔ)。此外，癌癥外顯子組測序也在臨床上大展拳腳。然而人們逐漸意識到，基因組非編碼區(qū)域的異常也在癌癥中起到了重要作用。
基因組的非編碼區(qū)域生成了大量的RNA轉(zhuǎn)錄本，長非編碼RNA（lncRNA）就是其中之一。lncRNA長達兩百個核苷酸以上，絕大多數(shù)位于細胞核內(nèi)。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質(zhì)，但它們在不同組織和發(fā)育階段的表達依然具有特異性，這說明lncRNA具有重要的生物學(xué)意義。全基因組癌癥突變分析顯示，非編碼基因組存在許多功能性突變，這些突變對lncRNA的表達水平影響很大。
斯坦福大學(xué)Howard Y. Chang教授在本期Cancer Cell雜志上發(fā)表文章，全面介紹了癌癥通路中的lncRNA。張教授出生于臺灣，畢業(yè)于哈佛大學(xué)，現(xiàn)任斯坦福大學(xué)首席研究員。曾入選HHMI2009年早期職業(yè)科學(xué)家項目（2009 Early Career Scientist Program），獲得百萬美元資助。近幾年張教授多次在Nature等頂級期刊上發(fā)表成果。
這篇文章概述了在癌癥中鑒定lncRNA生物指標的現(xiàn)狀，探討了lncRNA在癌癥病理中的一些已知作用。文章指出，lncRNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)控與細胞惡變有關(guān)，lncRNA還通過與其它大分子互作（包括DNA、蛋白質(zhì)和RNA）驅(qū)動重要的癌癥表型。這些引人注目的分子有望成為對抗癌癥的新靶標。
Salk研究所的科學(xué)家們在eLife雜志上發(fā)表文章，揭示了一種在癌癥發(fā)展過程中起關(guān)鍵作用的lncRNA。這種被命名為PACER的lncRNA控制著COX-2基因的表達，與炎癥和癌癥密切相關(guān)。這項發(fā)表在eLife雜志上的研究，為相關(guān)癌癥的治療提供了一條新途徑。
賓夕法尼亞大學(xué)研究團隊在卵巢癌、乳腺癌等12種癌癥中建立了將近14,000個lncRNA的DNA拷貝數(shù)圖譜。他們發(fā)現(xiàn)，1號染色體上的FAL1（focally amplified lncRNA）就是一個RNA癌基因。注射siRNA對FAL1進行RNA干擾，可以有效抑制小鼠體內(nèi)的人類卵巢瘤。這一研究成果發(fā)表在Cancer Cell雜志上。
非編碼RNA主要包括lncRNA和microRNA，它們可以調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子的表達、指導(dǎo)染色質(zhì)的重組和修飾、減少mRNA的翻譯對基因表達進行控制。非編碼RNA對維持細胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)非常關(guān)鍵，在癌癥中起到了重要的作用。Science Signaling雜志通過專題“Noncoding RNAs in cancer”，介紹了這類分子的生理和病理學(xué)功能。
