病毒變了又變，華美生物N501Y，P681H突變體蛋白高效率上新發(fā)布！
日期：2021-01-12 13:51:47
踩在2020的尾巴上
國家給全國人民送來了新年禮
新冠疫苗全民免費(fèi)接種
感謝為之努力的每一位先行者！
魔幻的2020將將過去
初始的2021還需警惕
畢竟，這場(chǎng)攻堅(jiān)戰(zhàn)
還未全面勝利
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廣東從一例英國輸入確診病例中發(fā)現(xiàn)突變株
2021年1月3日最新發(fā)布，廣東省疾控中心在一名英國輸入新冠肺炎確認(rèn)病例的咽拭子樣本中發(fā)現(xiàn)了B.1.1.7突變株，與近期英國報(bào)道的變異病毒基因序列高度相似。
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英國稱新冠病毒變異使傳染力高出70%，多國緊急關(guān)閉邊境
12月14日，英國首次報(bào)告了傳染性極強(qiáng)的新冠病毒突變株：B.1.1.7毒株，英國已將相關(guān)情況通報(bào)世界衛(wèi)生組織。
12月19日，英格蘭地區(qū)首席醫(yī)療官 Chris Whitty 表示，根據(jù)相關(guān)研究和分析，專家們認(rèn)為這一變異病毒「能夠更快地傳播」。Whitty 和英國首相 Boris Johnson 稱，變種病毒株的傳染力可能較原始病毒高出 70%。
英國倫敦等地再次緊急封鎖，英國衛(wèi)生部門宣布將在英格蘭部分地區(qū)實(shí)施新冠疫情防控級(jí)別4級(jí)禁令：待在家里。而在12月20日早些時(shí)候，在英國之外，多國已宣布禁止或暫停來自英國的人員入境。包括德國、意大利、比利時(shí)、奧地利、瑞士、愛爾蘭等歐洲國家就都與英國斷航，對(duì)英國旅客限制入境舉措。
新變異毒株有什么關(guān)鍵變化？
病毒變異是常態(tài)，問題是大多數(shù)情況下的變異是無足輕重，或者說對(duì)于致病性、致死率、傳染性等疫情趨勢(shì)沒有任何意義、不會(huì)產(chǎn)生影響。英國政府的新型與新發(fā)生呼吸道病毒威脅咨詢小組（Nervtag）成員Muge Cevik博士表示，迄今為止已經(jīng)觀察到新冠病毒發(fā)生過超過4000個(gè)變異，其中絕大多數(shù)毫無意義。
但這次的新變異株B.1.1.7有點(diǎn)不一樣。根據(jù)美國疾控中心（CDC）報(bào)道，B.1.1.7病毒株具有23個(gè)突變，包括14個(gè)非同義突變（氨基酸改變）、6個(gè)同義突變（非氨基酸改變）和3個(gè)刪除。
其中，有三個(gè)突變比較重要：
①N501Y——最令人擔(dān)憂的突變，因?yàn)樗淖兞舜掏坏鞍咨献钪匾牟糠?，也就是病毒用來和人體呼吸道細(xì)胞“首次親密接觸”的受體結(jié)合域。N501Y表示刺突蛋白的第501個(gè)氨基酸從天冬酰胺的N變成了酪氨酸的Y——被認(rèn)為強(qiáng)化了新冠病毒與人體呼吸道細(xì)胞上的ACE2受體的親和力。
②P681H表示第681位氨基酸從脯氨酸的P變?yōu)榻M氨酸的H——被認(rèn)為可能影響病毒融入細(xì)胞的能力。
③69-70del表示第69-70個(gè)氨基酸被刪除——被認(rèn)為可能會(huì)強(qiáng)化病毒逃離人體（抗體）免疫的能力，這在被大批處死的丹麥水貂身上也檢測(cè)到了。
世衛(wèi)組織：新冠病毒出現(xiàn)4種變異株
當(dāng)?shù)貢r(shí)間2020年12月31日晚，世衛(wèi)組織正式通報(bào)了新冠病毒自出現(xiàn)以來的主要變異情況，包括4種變體。
2020年1月底至2月初
新冠病毒出現(xiàn)D614G突變，到2020年6月，該變體成為全球范圍內(nèi)主要傳播的新冠病毒類型。研究表明，與初始毒株相比，該變體的感染性和傳播能力都更高，但不會(huì)引起更嚴(yán)重的疾病，也不會(huì)影響現(xiàn)有的診斷、治療、疫苗和公共衛(wèi)生措施的有效性。
2020年8月至9月
丹麥發(fā)現(xiàn)一種與水貂相關(guān)的新冠病毒變體，被丹麥相關(guān)部門命名為“Cluster 5”，具有此前未曾觀察到的變異。令人擔(dān)憂的是，該變體可能減少自然感染或接種疫苗后所產(chǎn)生的免疫保護(hù)的范圍和持續(xù)時(shí)間，相關(guān)評(píng)估仍在進(jìn)行。目前丹麥僅在9月發(fā)現(xiàn)了12例人體感染此變體的病例，該變體似乎并未廣泛傳播。
2020年12月14日
英國向世衛(wèi)組織報(bào)告了一種被命名為VUI 202012/01（亦稱為B.1.1.7毒株）的新冠病毒變體。初步的流行病學(xué)研究表明，該變體具有更強(qiáng)的傳播力，但其導(dǎo)致的疾病嚴(yán)重程度（以住院時(shí)間和28天死亡率評(píng)估）及再感染情況并沒有變化，大多數(shù)診斷工具不受影響。截至12月30日，世衛(wèi)組織六個(gè)區(qū)域中已有五個(gè)區(qū)域的其他31個(gè)國家和地區(qū)發(fā)現(xiàn)了此種變體。
2020年12月18日
南非檢測(cè)到一種新冠病毒變體，出現(xiàn)了N501Y突變，南非將其命名為501Y.V2變體，該變體正在南非三個(gè)省中迅速傳播。盡管此前英國發(fā)現(xiàn)的變異新冠病毒也有N501Y突變，但分析表明其與南非發(fā)現(xiàn)的變異新冠病毒是不同的變體。
初步研究表明，該變體與更高的病毒載量有關(guān)，可能會(huì)增加傳染性，但尚無證據(jù)表明其會(huì)引起更嚴(yán)重的疾病。還需展開進(jìn)一步調(diào)查，以了解該變體對(duì)病毒傳播、診斷、疫苗等方面的影響。世衛(wèi)組織同時(shí)指出，包括新冠病毒在內(nèi)的所有病毒都會(huì)隨時(shí)間推移而變化，大多數(shù)變異不會(huì)導(dǎo)致病毒傳染性增加，有時(shí)甚至?xí)拗破鋫鞑?。隨著人與動(dòng)物感染頻率的增加，病毒變異的可能性也會(huì)上升。
新變異毒株意味著什么？
在B.1.1.7譜系S蛋白的突變中，最值得注意的突變位點(diǎn)是RBD中的關(guān)鍵氨基酸突變N501Y，這個(gè)位點(diǎn)尤其重要。N501Y變異位點(diǎn)是新冠病毒Spike蛋白的受體結(jié)合區(qū)（RBD）關(guān)鍵位點(diǎn)之一。Spike蛋白（即棘突蛋白，S蛋白）是新冠病毒包膜上主要的受體結(jié)合蛋白，是它入侵人體細(xì)胞的關(guān)鍵“鑰匙”。而人體細(xì)胞上的受體“血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2（ACE2）”就像一個(gè)“鎖”，病毒上的S蛋白則相當(dāng)于“鑰匙”。病毒的S蛋白與細(xì)胞上的ACE2受體結(jié)合，從而打開感染人體細(xì)胞的大門。因此，發(fā)生在S蛋白受體結(jié)合區(qū)域（RBD）的變異可能增強(qiáng)病毒的傳染性和致病性，也可能引起針對(duì)疫苗的免疫逃逸，特別值得關(guān)注。今年7月30日，中國科學(xué)家周育森等人發(fā)表在 Science 的研究表明，新冠病毒適應(yīng)和感染野生型小鼠，正是因?yàn)橛辛诉@個(gè) N501Y突變。該突變大大增加了RBD與受體ACE2的親和力，從而增強(qiáng)新冠病毒對(duì)小鼠的感染性。
S蛋白中的P681H突變可能也對(duì)病毒特征有潛在影響，這一位點(diǎn)緊鄰S蛋白的S1/S2 Furin裂解位點(diǎn)，F(xiàn)urin裂解位點(diǎn)對(duì)新冠病毒感染宿主細(xì)胞至關(guān)重要，所以推測(cè)P681H對(duì)新冠病毒的感染性也可能有所影響，但目前還沒有明確的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。此外，S蛋白中的其他突變位點(diǎn)推測(cè)對(duì)功能影響不大，尚未引起關(guān)注。
在此前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)，D614G變異株新冠病毒可以增強(qiáng)S蛋白與人體細(xì)胞ACE2受體的結(jié)合力，從而大大增加新冠病毒的傳染性。目前，分子流行病學(xué)抽樣調(diào)研發(fā)現(xiàn)，D614G變異株已經(jīng)占到全球新冠病毒發(fā)病的70%以上，成為最主要的新冠流行毒株。幸運(yùn)的是，D614G變異株并沒有顯著增強(qiáng)病毒的致病力，而且該毒株也在目前批準(zhǔn)上市和應(yīng)急接種的疫苗保護(hù)之下。新冠病毒不斷的變異為疫苗和抗體藥物的研發(fā)提出了嚴(yán)重的挑戰(zhàn)。
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