從基因組背后尋找疾病的根源

日期：2013-01-10 09:45:03

通過破譯橫跨非洲、亞歐及美洲地區數國逾1000人的基因組圖譜，科學家已成功匯編了目前最詳盡的有關人類基因變異的研究目錄。這是一筆巨大的資源，它將有助于醫學研究人員從基因角度來追溯全人類罕見和常見疾病的根源。

200名來自圣•路易斯華盛頓大學醫學院及其他研究機構的科學家共同參與了這項“千人基因組計劃”。研究的結果發布在世界權威的科學學術期刊《自然》上，詳述了14個不同人類種群個體的基因變異研究報告。

華盛頓大學基因組研究所聯執主任兼此次基因項目研究領導人伊萊恩•馬爾蒂斯博士表示：“有了這樣的資源，醫學研究者們如獲至寶，因為它們可以指引研究者尋找出全球人類種群中疾病的基因根源。同時，研究還指出，每個人都攜帶著幾百個潛在致病的罕見基因變體?！?/SPAN>

從基因層面上看，任何兩個人都有超過99%的基因相似度。然而，盡管出現頻率極低（可能變異頻率僅為1%），但那些罕見的基因變異體仍被認為是引起罕見疾病乃至癌癥、心臟病、糖尿病等常見疾病的罪魁禍首。藥物治療對某些病人不起效，或出現惡心、嘔吐、失眠甚至一些心臟疾病或死亡等藥物副作用，都有可能是基因發生罕見的變異在作祟。此次科研小組研究的主要目標就是鑒定遍及不同人類種群間的罕見基因變異體。通過試點階段的研究發現，大多數罕見的基因變體在不同人類種群中的表現各不相同。這一點至關重要，它將促進科研人員對每個個體基因組的解讀。

最新的研究結果來自對以下種族的DNA測序：尼日利亞的約魯巴人、北京的中國漢人、東京的日本人、擁有北歐及西歐祖先血統的猶他人、肯尼亞的盧西亞人、擁有非洲祖先血統的美國人、意大利的托斯卡尼人、擁有墨西哥祖先血統的洛杉磯人、中國南方的漢族人、西班牙的伊比利亞人、英格蘭及蘇格蘭地區的英國人、芬蘭人、哥倫比亞人、波多黎各人。所有參與研究的人全部提交了匿名的DNA樣本，并同意將他們自己的基因數據放入在線數據庫。

為列出變異基因，研究員首先測序了所有實驗研究對象在內的全部基因組，如此重復操作大約5次，得到的結果是，普通DNA發生了變異，卻無法以此方法鑒定罕見基因變體。隨后，為找到罕見基因變體和確保研究結果的準確性，研究人員反復測序了每個個體包含基因的部分基因組片段，測序每人每段基因組片段的次數都多達大約80次，同時他們還密切關注著DNA序列中核苷酸的變化情況。

科學家通過使用先進的特殊設備分析和整合測試數據，發現了總共3800萬個SNP（單核苷酸）。其中包括試驗對象DNA樣本中超過99%且變異頻率大于等于1%的變異核苷酸。研究結果還發現，大量的人類基因組存在不同長度的結構變異，包括140萬基因組短片段序列的插入或缺失，14000個大段DNA缺失。