預測小分子抗癌活性有了新算法
日期：2012-12-20 09:17:34
記者從中科院昆明動物研究所獲悉，該所李功華博士在研究員黃京飛的指導下，開發了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，并成功應用于預測小分子的抗癌活性。近日，該研究發表在頂級計算生物學雜志《生物信息學》上。
據李功華介紹，開發新的抗癌藥物是科學界和醫學界的熱點和難點。直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例，現在已知的小分子化合物超過了1000萬個，因此，直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此，建立一個高效、可靠、準確的抗癌藥物的計算生物學篩選系統對發掘新的抗癌藥物具有重要意義。
為建立抗癌藥物活性的計算生物學預測系統，李功華開發了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，通過交叉驗證發現其預測的線下面積達到了0.878，顯示該算法能很好地預測藥物小分子的抗癌活性。
同時，李功華還開發了一個簡便易用的預測抗癌藥物活性的網頁服務器，使該算法能被不同學科的研究者和醫藥工作者所應用。
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