Nature重要成果：全基因組→癌癥標記
日期：2012-06-12 11:51:41
由華盛頓大學圣路易斯分校（排名見2012全美最佳研究生院排名（醫學基礎研究））領銜的研究團隊發表了題為“Whole-genome analysis informs breast cancer response to aromatase inhibition”的文章，通過分析患有晚期乳腺癌患者的DNA序列，發現了不同癌癥的標記，這將有助于預測雌激素降低治療的療效，并深入解析乳腺癌為何能快速增殖并擴散。相關成果公布在Nature雜志上。
文章通訊作者，華盛頓大學醫學院基因組研究所主任Elaine Mardis 說，“這是首次利用癌癥基因組研究成果，分析未知癌癥突變，用以找到與治療療效和其它臨床特征相關的突變”，“如果這項研究成果在更大規模中得到了驗證，那么我們認為基因組信息就能成為臨床醫師，在多種治療方案中進行選擇的一個重要數據?！?/SPAN>
乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤之一，這種疾病通常發生在乳房腺上皮組織，發病率占全身各種惡性腫瘤的7-10%，是一種嚴重影響婦女身心健康甚至危及生命的最常見惡性腫瘤之一。
這項研究選取了77位絕經后，第二階段或第三階段雌激素受體陽性乳腺癌患者（此類患者是最常見的乳腺癌形式），雌激素能刺激這些腫瘤的生長，因此這些女性患者需要接受芳香化酶抑制劑的治療，以降低體內雌激素的含量。這些藥物能縮小乳腺癌腫瘤的大小，幫助許多女性免除了切乳手術。但是這種治療方法只在某些患者身上有效，對此醫生們并不了解其中的原因。
為了解答這一疑問，研究人員比對了患者腫瘤樣品，以及健康細胞中的DNA，從中試圖尋找只出現在癌細胞中的突變，利用這種方法，研究人員發現了患者癌細胞中的所有突變，而不僅僅是某些預期會出現的突變。
研究的腫瘤樣品來自兩項腫瘤樣品芳香化酶抑制劑臨床試驗之一，研究人員收集了患者腫瘤的詳細信息，其中包括其是否對手術前，為期四個月的芳香化酶抑制劑治療作出應答。其中29個腫瘤樣品來自對芳香化酶抑制劑治療發生抵抗的患者樣品，48個樣品來自作出反應的患者腫瘤樣品。
研究人員發現對雌激素降低藥物作出應答的腫瘤樣品，相對來說突變較少，而那些抵抗治療的患者則突變率更高，基因組更加復雜。
研究人員在腫瘤樣品中發現了18個顯著的突變基因，這些基因比預期的更常發生改變，其中一些是已知的重要乳腺癌基因，但是還有一些是出乎意料之外的，比如參與白血病的基因。
為了分析這18個基因的臨床意義，研究人員擴大了實驗范圍，加入了另外的240位雌激素受體陽性乳腺癌患者，她們對芳香化酶抑制劑治療也有相關記錄。
結果研究人員在許多患者癌癥中發現了幾個相對常見，與治療應答有關的基因——大約20%的腫瘤樣品發生了一種重要抑癌基因：TP53的突變，這些突變關系著芳香化酶抑制劑療效差，以及更易擴散的快速擴增腫瘤。帶有TP53突變的患者也更加容易患者一種稱為luminal B的乳腺癌亞型，這種亞型預后效果差。
相反，出現在16%的患者中的另外一種突變：MAP3K1，以及其姊妹基因MAP2K4，則與芳香化酶抑制劑治療療效好相關聯。帶有這些基因的患者腫瘤生長速度較慢，并且不會擴散，常屬于luminal A乳腺癌，預后效果好。
還有一個稱為GATA3的基因，也似乎與好的芳香化酶抑制劑治療療效有關，而MALAT1，一個長鏈非編碼RNA則指向不良療效。
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