癌基因組測(cè)序證實(shí)Nature前文結(jié)論
日期：2012-05-11 08:40:11
一直以來(lái)，科學(xué)家們都認(rèn)為皮膚癌中最致命和最具威脅性的一類(lèi)癌癥與太陽(yáng)光有關(guān)，2010年一個(gè)研究小組在Nature雜志上公布了肺癌與皮膚癌的癌癥基因組，指出患有其中皮膚癌的患者由于受到了光照的影響，因而基因組發(fā)生了癌變。這說(shuō)明皮膚癌實(shí)際上是可以預(yù)防的。今天（5月10）公布的另外一篇Nature文章又再次證明了這一觀(guān)點(diǎn)，證實(shí)了慢性光照在其中扮演的重要角色，從而揭示了腫瘤形成新型遺傳變化。
這種皮膚癌就是黑色素瘤，這是一種惡性程度極高的皮膚惡性腫瘤，病程進(jìn)展迅速。黑色素瘤的發(fā)病率隨人種、地域、種族的不同而存有所差異，白種人的發(fā)病率遠(yuǎn)高于黑種人高，我國(guó)雖屬黑色素瘤的低發(fā)區(qū)，但進(jìn)入21世紀(jì)后發(fā)病率卻呈不斷上升趨勢(shì)。
黑色素瘤基因突變與重排
在這篇文章中，研究人員通過(guò)對(duì)25位患有該種疾病的患者樣品進(jìn)行測(cè)序分析，首次進(jìn)行了黑色素瘤高分辨率分析。文章通訊作者之一，Broad研究院資深研究員Lynda Chin說(shuō)，“人類(lèi)黑色素瘤全基因組分析首次表明，在這種癌癥類(lèi)型中存在如此多的結(jié)構(gòu)重排”，Chin教授之前在Dana-Farber研究院工作，目前已進(jìn)入德州大學(xué)MD Anderson癌癥中心，擔(dān)任基因組醫(yī)學(xué)部主任。
與預(yù)期的一樣，研究人員在25個(gè)腫瘤樣品的24個(gè)中發(fā)現(xiàn)了已知的BRAF和NRAS突變，這兩個(gè)基因都是細(xì)胞生長(zhǎng)過(guò)程中的重要信號(hào)分子。
還有另外一個(gè)突變也備受關(guān)注，那就是PREX2突變，這個(gè)突變出現(xiàn)在基因中斷（genetic disruption）的一個(gè)交聯(lián)處，此處基因中斷可能可促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)。這些突變并不只是在通常開(kāi)啟致癌基因的熱點(diǎn)處出現(xiàn)，也散布在這一基因片段各處，并且常常以另外一種癌癥相關(guān)基因：抑癌基因被關(guān)閉的形式出現(xiàn)。
“這種突變模式看上去更像抑癌基因，但是從功能實(shí)驗(yàn)中，我們發(fā)現(xiàn)這更有可能是一個(gè)致癌基因”，文章的第一作者Michael F. Berger說(shuō)。當(dāng)PREX2正常工作的時(shí)候，它能與PTEN蛋白相互作用，后者正是一個(gè)抑癌因子。Chin教授原Dana-Farber實(shí)驗(yàn)室的小鼠實(shí)驗(yàn)證明，PREX2突變可以促進(jìn)腫瘤以一種目前還并不十分了解的方式擴(kuò)增。
證實(shí)之前的研究
除此之外，研究人員還證實(shí)了一些早期的發(fā)現(xiàn)，2010年科學(xué)家們分析了肺癌與皮膚癌的癌癥基因組，發(fā)現(xiàn)黑素瘤患者的基因組有33,345個(gè)明顯突變，肺癌患者的基因組有22,910個(gè)明顯突變。這些突變并不均勻地分散在基因組上，而是集中出現(xiàn)在基因編碼區(qū)域外圍。
這項(xiàng)研究表明可通過(guò)追蹤這些變異來(lái)測(cè)定致癌因素對(duì)癌癥發(fā)生的影響程度大小。而這些針對(duì)致癌因素的追蹤研究發(fā)現(xiàn)，其實(shí)皮膚癌和肺癌是可以預(yù)防的。
在這項(xiàng)研究中，研究人員也發(fā)現(xiàn)機(jī)體并未常受到光照的腫瘤出現(xiàn)區(qū)域中，每百萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)中會(huì)出現(xiàn)3-14個(gè)突變，而經(jīng)常進(jìn)行高光照的病患樣品，則每百萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)中會(huì)出現(xiàn)111個(gè)突變。
在未常受到光照的機(jī)體區(qū)域腫瘤中出現(xiàn)了曬傷痕跡——比如腳底——證明了光照在黑色素瘤發(fā)生過(guò)程中的作用，美國(guó)非盈利黑色素瘤聯(lián)盟科學(xué)項(xiàng)目部主任Laura Brockway-Lunardi說(shuō)。
“黑色素瘤的發(fā)病率越來(lái)越高，尤其是在年輕女性當(dāng)中，這可以歸咎于光照以及室內(nèi)照射”，Brockway-Lunardi說(shuō)。
