研究首次實現高通量小RNA芯片非標記檢測
日期：2011-10-17 08:57:32
microRNA是近年來發現的一種單鏈的短鏈RNA，長度約22個堿基，在動植物及人類中廣泛存在，與發育、分化、凋亡、脂肪代謝、病毒感染和癌癥等多種重要生物學過程有密切的聯系，并顯示出作為癌癥、心血管等重大疾病等方面的新的分子標記物的巨大潛力，是近十年來的一個研究的熱點。對microRNA表達譜進行高通量、低成本的檢測對于該領域的發展具有重要的意義。
中科院蘇州納米技術與納米仿生研究所李炯課題組與生物物理所閻錫蘊課題組合作，首次實現了高通量microRNA芯片的非標記檢測，而其他芯片和測序技術需要數小時的手工操作才能完成標記，從而大幅度降低了檢測的標記時間和成本。
與其他商業化microRNA芯片技術相比，該技術還具有如下獨特的優勢：1. 高靈敏度，由于減少了標記帶來的損失，僅用100ng的總RNA就可以得到較好的結果；2. 完美識別前體microRNA，解決了芯片技術在這方面的缺陷，因此無需純化小RNA，可以直接使用總RNA，減少了實驗的操作步驟；3. 可以對microRNA鏈中的中間或者是兩端的單堿基錯配都能有效識別，這也是其他芯片技術無法實現的；4. 可應用于植物microRNA表達譜檢測。植物microRNA在3端普遍存在甲基化的問題，對于主流的酶標記方法來說效率很低（~10%），因此多數芯片技術無法直接應用于植物microRNA表達譜的檢測，測序技術在文庫構建的時候也會受到類似的影響，少數公司則采用了非主流的化學標記的方法。而該技術基于核酸雜交，完全不受甲基化的影響。另外，該技術無需特殊設備，常規的芯片制作和掃描設備就可以應用，從而最大程度地減少了進入市場的難度。
即使與現在發展迅猛的測序技術相比，該技術對于microRNA表達譜檢測在通量（大量樣品）、成本、靈敏度以及后續的數據分析等方面仍然具有明顯的優勢。該工作近期發表于Nucleic Acid Research雜志上。
目前，研究人員正努力標準化該技術，為其盡早進入市場鋪平道路。
上一篇： 治療鐮狀細胞貧血病在美獲進展
下一篇： 英首次精確修正肝病患者干細胞基因變異
