Cell：白血病細胞的整體遺傳相互作用網絡首次繪制出
日期：2017-02-08 08:52:59
眾所周知，癌癥是一種異質性的疾病，有許多不同的亞型。這些癌癥依賴不同的通路來存活，對癌癥治療藥物也有著不同的反應。對研究人員來說，挑戰在于如何精確定義這些不同的通路，并找到脆弱之處，以此作為藥物治療的靶點。
近日，美國Whitehead研究所和Broad研究所的研究人員在這方面邁出了重要一步：他們成功鑒定出14種人類急性髓性白血病（AML）細胞系中的一組關鍵基因，它們是細胞增殖和存活所必需的。將這份“基因必要性圖譜”與現有的基因組信息相結合，此研究將有助于新療法的開發。這項研究成果于2月2日發表在《Cell》雜志上。
在這項研究中，研究人員將重點放在與Ras癌基因相關聯的基因和蛋白通路上。Ras基因是人類癌癥中經常發生突變的癌基因，在急性髓性白血病及其他癌癥中發揮重要作用。
這篇論文的第一作者，Whitehead研究所和Broad研究所的研究生Tim Wang表示：“在大多數情況下，Ras蛋白的突變體都被認為是‘無藥可靶向的（undruggable）’。不過，替代方法是找到Ras突變癌癥依賴的其他基因，希望其中的一個能夠成為藥物靶點。不幸的是，這種‘Ras合成致死’基因目前仍難以確定。”
于是，研究人員利用基于CRISPR的遺傳篩查技術，全面評估18,000個蛋白編碼基因對人類基因組的影響。這些數據的分析以及后續工作揭示了之前未研究的基因的分子功能，鑒定出與Ras突變體的致死相互作用。這篇論文的資深作者、麻省理工學院的David Sabatini表示：“這個過程能夠讓我們鑒定出Ras突變細胞所必需的基因列表。”
同時，研究人員也關注了一些基因，它們在某些細胞系中必不可少，而在其他細胞系中可有可無。對于每一個基因，研究人員通過數據篩選，找到必要性模式匹配的其他基因，認為它們有著類似的功能。事實上，這種分析揭示了共同作用的基因組合，并發現了之前未知或未研究過的基因關聯。
