Nature：“天字0號”艾滋病病毒是錯判
日期：2016-10-28 08:55:25
在上世紀80年代，當時艾滋病在美國的同志群內快速傳播，死亡患者中有個無人不知、惡名遠播的天字0號病人“Patient Zero”。他名字叫Gaeten Dugas，是一名來自加拿大魁北克的機艙服務員，他被認為是美國艾滋病病毒傳播的源頭之一。然而10月26日Nature雜志公布的一項最新研究表明，艾滋病病毒其實首先是在上個世紀70年代左右從海地傳播到了紐約，然后在70年代中期擴散到了舊金山等處。
這組研究人員完成了來自1978-1979年間的8個樣品的HIV病毒完整基因組測序，這是首個1981年前北美地區HIV病毒測序研究，通過分子鐘與系統進化分析，研究人員確定了艾滋病病毒是在70年代左右從海地傳播到了紐約，再傳播到舊金山等處。
其中一份樣品來自Gaëtan Dugas，從美國艾滋病毒進化樹中可以看出他并不是艾滋病病毒最初在美國傳播的罪魁禍首。
同時研究人員還指出，美國疾控中心(CDC) 的調查人員中心最初將Dugas稱為“Patient Zero”，是為了表明他居住在“加州以外”，并沒有指向他為HIV第一例感染，只是之后被誤傳而已。
此次研究中的一個關鍵在于樣品的恢復，文章作者，亞利桑那大學的Michael Worobey表示，“眾所周知，之前的血清樣品由于RNA會降解而難以恢復。”
為了從HIV毒株中找到北美地區的基因組，Worobey等人研發出了一種新技術，他們將其命名為RNA “jackhammering”技術，即利用許多不同的引物擴增多個池中的短片段RNA，這樣每個池中創建的部分基因組就能重疊，合在一起這些短片段能填滿完整的基因組。
“這個技術方法真是絕了，”來自西北大學Evanston醫學院的Steven Wolinsky（未參與該項研究），“得到的數據很好，分析結果驚人。”
研究人員通過比對八個恢復后的基因組與參考艾滋病毒基因組，構建了B亞型HIV基因組進化樹，發現舊金山的患者來自紐約，而且紐約樣品毒株要比舊金山的遺傳多樣性多，這表明前者變異的更早。來自海地的B亞型基因組差別最大，因此可能是美國毒株的起源，分子鐘數據表明海地的HIV來自非洲，也就是HIV的最初發源地。
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