Nature里程碑成果：世界上最大的人類基因組變異目錄
日期：2015-10-13 08:53:30
由千人基因組計(jì)劃協(xié)會領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國際科學(xué)家小組，構(gòu)建出了世界上最大的人類基因組變異目錄，可為研究人員提供有價(jià)值的線索幫助他們確立一些人容易罹患各種疾病的原因。盡管大多數(shù)的人類基因組變異都是無害的，一些甚至是有益的，但也有些變異卻可導(dǎo)致疾病，造成認(rèn)知障礙，影響癌癥、肥胖、糖尿病、心臟病和其他疾病的易感性。了解基因組變異導(dǎo)致疾病的機(jī)制或可幫助臨床醫(yī)生改進(jìn)診斷及治療方法及開發(fā)出新的防治對策。
在發(fā)表于《自然》（Nature）雜志上的兩篇研究論文中，研究人員檢測了跨越非洲、亞洲和南亞、歐洲與美洲26個(gè)種族2,504人的基因組。
在第一篇Nature文章中，研究人員鑒別出了人類基因組中因人而異的大約8800萬個(gè)位點(diǎn)，建立了一個(gè)數(shù)據(jù)庫提供給研究人員作為標(biāo)準(zhǔn)參考，確定在種群中及世界各地人類基因組組成的變異。這一目錄將人類基因組中已知變異位點(diǎn)增加了一倍多，現(xiàn)可用于廣泛的人類生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中，為深入認(rèn)識DNA遺傳變異促成疾病風(fēng)險(xiǎn)及藥物反應(yīng)的機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
在鑒別出的8800多萬個(gè)變異位點(diǎn)中，大約1200個(gè)位點(diǎn)具有可能被許多種群共享的常見變異。研究顯示非洲人群具有最大的基因組多樣性，這與人類起源于非洲，并從非洲遷移至世界各地建立其他種群的事實(shí)相符。
國家人類基因組研究所(NHGRI)基因組變異項(xiàng)目主任Lisa Brooks博士說：“人類基因組中大約有8800萬個(gè)位點(diǎn)因人而異。其中大約四分之一的變異是常見的，存在于許多或所有種群中，而大約四分之三存在于僅1%的人群中或甚至更為罕見。千人基因組計(jì)劃為科學(xué)家們開展研究，探究疾病中的基因組貢獻(xiàn)，包括研究常見和罕見變異提供了一個(gè)資源。
在第二篇Nature論文中，科學(xué)家們調(diào)查了2,504個(gè)樣本中的基因組結(jié)構(gòu)變異。他們發(fā)現(xiàn)了近6.9萬個(gè)結(jié)構(gòu)變異。這些基因組變異，包括缺失、插入和復(fù)制，其中許多影響了基因。研究人員構(gòu)建出了8類結(jié)構(gòu)變異的圖譜，這些結(jié)構(gòu)變異潛在地促成了疾病。
歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室基因組生物學(xué)部負(fù)責(zé)人及歐洲研究委員會研究員Jan Korbel說：“結(jié)構(gòu)變異是造成人類基因組大比例DNA變異的主要原因。從來沒有研究以這樣廣泛的代表性來調(diào)查世界各地種群的基因組結(jié)構(gòu)變異。”
Korbel和同事們發(fā)現(xiàn)，這些結(jié)構(gòu)變異比他們原來認(rèn)為的要更為復(fù)雜。例如，大多數(shù)倒位（DNA序列在基因組中改變它們的方向）常常與其他的結(jié)構(gòu)改變共同發(fā)生。
密西根大學(xué)生物統(tǒng)計(jì)學(xué)教授、Nature研究的共同項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Gonalo Abecasis說，千人基因組計(jì)劃的價(jià)值超越了數(shù)據(jù)。
資深作者及項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Adam Auton博士說：“千人基因組計(jì)劃為其他人解答真正有意思的問題奠定了基礎(chǔ)?，F(xiàn)在每個(gè)人都想知道關(guān)于人類疾病這些變異會告訴我們些什么。”
