RNA相關名詞

日期：2010-08-05 11:50:21

1.RNAi：

近年來的研究表明,一些小的雙鏈RNA可以高效、特異的阻斷體內特定基因表達，促使mRNA降解，誘使細胞表現出特定基因缺失的表型，稱為RNA干擾（RNA interference，RNAi，也譯作RNA干預或者干涉）。它也是體內抵御外在感染的一種重要保護機制。

2.siRNA：

siRNA（small interfering RNAs）是一種短片斷雙鏈RNA分子，能夠以同源互補序列的mRNA為靶目標降解特定的mRNA，這個過程就是RNA干擾途徑（RNA interference pathway）。

3.RISC：

在RNAi效應階段，siRNA雙鏈結合一個核酶復合物從而形成所謂RNA誘導沉默復合物（RNA-induced silencing complex, or RISC）。激活RISC需要一個ATP依賴的將siRNA解雙鏈的過程。激活的RISC通過堿基配對定位到同源mRNA轉錄本上，并在距離siRNA3端12個堿基的位置切割mRNA(3, 18, 27, 29)。盡管切割的精確機制現在還是未知，研究表明每個RISC都包含一個siRNA和一個不同于Dicer的RNA酶。

4.Dicer：

Dicer的酶，是RNaseIII家族中特異識別雙鏈RNA的一員，能以一種ATP依賴的方式逐步（processive）切割由外源導入或者由轉基因、病毒感染等各種方式引入的雙鏈RNA，切割將RNA降解為19―21bp的雙鏈RNAs(siRNAs)，每個片斷的3端都有2個堿基突出(27, 28)。

5.PTGS：

Post-transcriptional Gene Silencing (PTGS) 部分的植物中的基因沉默是在轉錄后發生的，稱為post-transcriptional gene silencing。它是相對于部分植物中發生的轉錄階段的基因沉默（PGS）而言的。

6.基因沉默：

研究結果發現有大量的轉基因植株不能正常表達，通常這并不是由于轉基因的缺失或突變引起的，而是基因失活的結果.這種失活的現象稱為基因沉默。

7.RNA transfection：

即RNA轉染。

8.Sense RNA：

正義RNA。

9.Antisense RNA：

反義RNA。

10.19+2+2 nt siRNA：

在細胞中雙鏈RNA一般都被切割成21-23小片段，這樣的RNA片段能達到更好的RNAi作用。人工合成的siRNA也是依據這個原理，所合成的RNA就是19nt的堿基序列再加上兩端的識別序列如-GG，-TT等。

11.BLAST：

Basic Local Alignment Search Tool，基本的基于局部對準的搜索工具；一種快速查找與給定序列具有連續相同片斷的序列的技術。

12.Entrez：

美國國家生物技術信息中心所提供的在線資源檢索器。該資源將GenBank序列與其原始文獻出處鏈接在一起。

13.NCBI：

美國國立生物技術信息中心（National Center for Biotechnology Information），為美國國家醫學圖書館（NLM）和國家健康協會（NIH）下屬部門之一，1988年設立。主要提供生物醫學領域的信息學服務，如世界三大核酸數據庫之一的GenBank數據庫，PubMed醫學文獻檢索數據庫等。

14.GenBank：

GenBank 是 NIH 的基因序列數據庫，是所有公開的DNA序列的集合 ( Nucleic Acids Research 1998 Jan 1;26(1):1-7). 截至1998年12月，GenBank大約收集了 2,162,000,000 個堿基、3,044,000 個序列。

15.DUST：

A program for filtering low complexity regions from nucleic acid sequences。

16.Ribosomal RNA：

核糖體RNA，簡寫為rRNA。是一組存在于核糖體中的RNA分子。

17.UniGene：

美國國家生物技術信息中心提供的公用數據庫，該數據庫將GenBank中屬于同一條基因的所有片斷拼接成完整的基因進行收錄。