Sci Transl Med：有效診斷遺傳疾病的新方法

日期：2014-09-18 13:50:34

被懷疑患有遺傳病的人當中，只有不到一半的的人能真正得到滿意的診斷。目前，柏林大學醫院中心區分院（Charité - Universitätsmedizin Berlin）和馬克思普朗克分子遺傳學研究所的科學家們，將新一代測序技術（NGS）、生物信息學和臨床數據進行整合，開發出一種有效的診斷程序，可顯著增加受影響患者的診斷前景。該程序免費提供給相關醫療機構，并可以立即使用。相關研究結果發表在最近的《科學轉化醫學》（Science Translational Medicine）雜志。

要實施合適的治療，第一步是準確的診斷——即使在無法醫治的情況下，這是非常重要的。PhenIX診斷程序的開發者之一Peter Robinson稱：“至少，它提供了保證，疾病不是由自己造成的。”PhenIX代表“Phenotypic Interpretation of eXomes”。在過去，只能對這類疾病進行遺傳學分析。然而，這往往不足以準確地檢測疾病。所有檢測的問題在于，患者的個體差異使診斷變得很困難，來自于每個人固有規范的數百萬個遺傳偏差當中，必須找到重要的差異。

為了解決這個問題，柏林的科學家們開發了一種創新性的診斷程序。與以往的診斷檢測方法形成對照，PhenIX將遺傳異常分析與患者的臨床表現結合起來。在第一步中，進行一個特定的搜索，尋找已知引起疾病的大約3000個基因。為了找出它們是哪些基因，科學家們系統地搜索了公開可用的數據庫，并創建了已知遺傳缺陷的一個列表。一旦這些工作完成，幾百個遺傳異常通常仍然停留在患者的基因組中，作為候選的疾病起因。

第二步中，主治醫師瀏覽Human Phenotype Ontology (HPO)——Charité開發的一個數據庫，以尋找患者的癥狀。這也包含可能引起疾病的遺傳缺陷的一個列表。然后，當醫生檢測兩種分析方法之間的重疊時，會發現一個候選者列表，往往包含不超過20種可能的病因，包括按概率排序。通過這個列表檢測疾病，相對比較容易。

在試點研究中，研究人員檢測了一組患者，他們的遺傳疾病是已知的。在每一個病例中，PhenIX都能正確地診斷疾病。其他一些患者也接受了檢測，盡管進行了多年的努力密集調查，這些人并沒有獲得診斷。當使用PhenIX方法時，這些患者中有超過25%的人能夠找出他們的確切病因。

PhenIX可用于具備必要技術裝備的醫院。Robinson稱：“通過臨床表現與遺傳分析相結合，我們已經向前邁進了一大步——新方法意味著醫生只需要兩小時的工作。”他承諾，即使在未來，這個程序的一個免費版本將是始終可用的。他認為，將來有望進一步改善數據庫的更標準化處理。他這樣說道：“醫生有時候不知道應該如何確切地描述一種癥狀，或者他們知道特定的癥狀有不同的名稱。”一定的準則，可使搜索過程更加成功，因此，在未來診斷可以變得更快速和更準確。