Nature解析癌癥與“垃圾”DNA
日期：2014-07-24 08:54:20
癌癥是由多次遺傳改變（或突變）而引起的一類疾病。我們從父母那里繼承了或強或弱的形成某些癌癥類型的遺傳易感性；此外，在我們的一生中我們的細胞內也會不斷地累積新的突變。盡管已開展了很長一段時間的癌癥遺傳起源研究，直到現在研究人員仍無法估量基因組一些非編碼區域的作用。
來自日內瓦大學(UNIGE)的遺傳學家們組成的一個研究小組，通過研究來自結直腸癌患者的組織，成功地解碼了我們的基因組中這一未經探索過的、至關重要的組成部分。他們的研究結果發布在《自然》（Nature）雜志上。
為了更好地了解癌癥的形成機制，科學家們一直在努力地鑒別有可能促進或觸發腫瘤發展的（遺傳性或獲得性）遺傳因子。然而直到現在，還只是在構成基因組2%的編碼區域中檢測癌癥的遺傳基礎。近期的一些科研進展表明，其余98%的區域并非沒有活性：其中包含了一些調控基因表達的元件，因此在癌癥的形成中發揮重要的作用。
為了更好地了解這一作用，日內瓦大學醫學院遺傳與發育醫學系教授Emmanouil Dermitzakis和他的研究小組對最常見且最致命的一種癌癥：結直腸癌展開了研究。每年，全球有100萬的新增結直腸癌病例，大約一半的患者因此喪命。
利用基因組測序技術，日內瓦大學的科學家們比較了來自103名患者健康組織和腫瘤組織的RNA，在廣大的基因組非編碼區域內尋找了影響結直腸癌形成的調控元件。他們的目的是鑒別出只存在于癌組織中的一些獲得性突變的效應，這些突變激活觸發了這一疾病。這是一種全新的方法：是第一項研究以如此規模檢測癌癥患者基因組的非編碼區域。
未知的突變
這一研究小組鑒別了兩種影響結直腸癌形成的非編碼突變。一方面，他們發現一些遺傳性的調控性變異在健康組織中并不活化，其在腫瘤中激活似乎促進了癌癥發展。結果表明，我們繼承的基因組不僅影響了我們罹患癌癥的遺傳傾向，還影響了它的進展。另一方面，研究人員確定了一些獲得性突變對于基因表達調控的影響，它們由此影響了結直腸癌的發生與發展。
研究的主要作者Halit Ongen 說：“定位在基因組非編碼區域中、導致了癌癥形成與發展的這些元件，與定位在基因組編碼區域內的那些元件一樣重要。因此在我們整個基因組中分析遺傳因子，而不只是像過去一樣限于編碼區域，將為我們提供更為全面的結直腸癌背后的遺傳學知識。”“在這里我們將這一完全創新性的方法應用于結直腸癌，此外還可以應用它來了解所有癌癥類型的遺傳學基礎，”Dermitzakis教授說。
上一篇： Nature：印記基因的重要影響
