科學家完成迄今最大基因組測序
日期：2014-04-03 09:08:24
生長在美國佐治亞州奧古斯塔國家高爾夫俱樂部第17號洞附近的火炬松（Pinus taeda）曾擋住了美國前總統德懷特·戴維·艾森豪威爾的很多桿球。1956年，他曾試圖砍掉這棵樹。如今，火炬松正在書寫一段與眾不同的歷史：火炬松的基因組有221.8億個堿基對——約為人類基因組的7倍多，是目前已完成測序的最大基因組。
火炬松原產于美國東南部，是美國南方松中重要的速生針葉用材樹種。在基因測序工作伊始，火炬松就被確定為研究對象。然而，火炬松基因組的龐大規模給傳統的全基因組“鳥槍法”測序（只能對短的基因組片段進行測序）出了一道難題。
新研究中，研究人員改進了原有的“鳥槍法”——利用基因克隆方法對單獨的DNA片段進行預處理，因而能夠更容易地拼裝出一個完整的基因組。該團隊發現，82%的火炬松基因組由重復的基因片段組成——而人類基因組中重復的基因片段只占25%。研究人員將該結果發表于近日的《基因組生物學》和《遺傳學》雜志上。研究人員還確定了能解釋火炬松重要特性（例如抗病性、木材形成、應激反應）的基因。
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