mBio：揭秘新型冠狀病毒
日期：2012-11-21 08:25:22
今年早些時(shí)候，首先出現(xiàn)在沙特阿拉伯的一種新型冠狀病毒已經(jīng)陸續(xù)導(dǎo)致三人致病，其中一人死亡。這無(wú)疑又給全球醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)敲響了警鐘。十一月二十日美國(guó)微生物學(xué)會(huì)旗下的mBio雜志發(fā)表了一項(xiàng)新研究，將這種新型病毒與蝙蝠體內(nèi)的病毒聯(lián)系起來(lái)。研究人員對(duì)HCoV-EMC/2012病毒進(jìn)行了測(cè)序研究，分析了該病毒與其他病毒的關(guān)系及其潛在來(lái)源。這一測(cè)序分析的結(jié)果將有助于人們對(duì)這一新興病毒進(jìn)行治療。
“該病毒與亞洲蝙蝠體內(nèi)的病毒親緣關(guān)系最近，與已知人類(lèi)病毒并不相關(guān)?！痹撗芯康念I(lǐng)導(dǎo)者，荷蘭Erasmus醫(yī)療中心的Ron Fouchier說(shuō)，“因此，我們推測(cè)它來(lái)源于動(dòng)物。”
早前感染這一新病毒的60歲沙特阿拉伯老人，經(jīng)歷了急性肺炎和腎衰竭并最終死亡，這不禁讓人們聯(lián)想起了以往的冠狀病毒疫情，2002年SARS病毒最終導(dǎo)致超過(guò)900人死亡。在此之后，又有兩位患者受到了類(lèi)似病毒的感染，自此HCoV-EMC/2012病毒引發(fā)了人們的高度關(guān)注。
目前，其中一位卡塔爾患者正在倫敦一家醫(yī)院接受治療。研究人員對(duì)這位患者體內(nèi)的病毒進(jìn)行了全基因組測(cè)序，并于11月13日完成。Fouchier指出，這一病毒與他研究中的HCoV-EMC/2012病毒非常吻合，只有99個(gè)單核苷酸差異。
“在整個(gè)基因組中99個(gè)核苷酸差異意味著0.3 – 0.4%的差異，很明顯它們屬于同一種病毒，”Fouchier說(shuō)，“這也帶來(lái)了新問(wèn)題。”另一位沙特阿拉伯患者也被認(rèn)為受到這種新病毒感染，不過(guò)其病毒基因組測(cè)序還未完成。
該研究中HCoV-EMC/2012病毒基因組測(cè)序達(dá)到了90%的覆蓋度，并且通過(guò)傳統(tǒng)Sanger測(cè)序進(jìn)行了驗(yàn)證。研究人員通過(guò)進(jìn)化分析，將該病毒分入Betacoronavirus屬，在已測(cè)序的病毒中與它親緣最近的是BtCoV-HKU4和BtCoV-HKU5，這兩種病毒分別分離自亞洲的扁顱蝠Tylonycteris pachypus和普通伏翼蝠Pipistrellus abramus。HCoV-EMC/2012與BtCoV-HKU5病毒序列只有77%的相似度，這樣的差異使其完全有資格被稱(chēng)為新型病毒。
此前一項(xiàng)沙特阿拉伯的血清學(xué)研究顯示，醫(yī)院中2,400名患者體內(nèi)均不含有該病毒相應(yīng)抗體，再加上HCoV-EMC/2012病毒與蝙蝠病毒相似性較高，Fouchier認(rèn)為這種病毒才剛開(kāi)始感染人類(lèi)，鑒于沙特阿拉伯及鄰近國(guó)家均有伏翼蝠出沒(méi)，這次病毒感染的源頭可能就是蝙蝠。
研究人員指出，在倫敦接受治療的患者所攜帶的病毒與HCoV-EMC/2012關(guān)系很微妙，二者有足夠的相似性說(shuō)明它們屬于一種病毒，它們之間又存在足夠的差異性暗示二者并非來(lái)自同一個(gè)感染源。
該研究除了有助于探明新病毒來(lái)源及其與疾病的關(guān)系，還能幫助人們對(duì)這類(lèi)病毒進(jìn)行深入研究，例如可以人工合成病毒基因組，在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)構(gòu)建病毒，以研究其毒力來(lái)源。同時(shí)一個(gè)注釋良好的基因組將為人們提供很大幫助，來(lái)開(kāi)發(fā)合適的診斷治療方法并生產(chǎn)相應(yīng)疫苗。
