JCB：發(fā)布細胞生物學“Google地圖”
日期：2012-08-08 08:17:54
通過Google地圖我們動動鼠標就可以從地球全景圖拉近到自家后院，近日荷蘭Leiden大學醫(yī)學中心的科學家們在Journal of Cell Biology雜志上發(fā)布了細胞生物學的“Google地圖”，并將其稱為虛擬納米顯微鏡。現(xiàn)在人們可以通過該成果從整個胚胎的生物組織全景放大到各個亞細胞結(jié)構(gòu)進行觀察，這都要歸功于近年來電鏡和圖像處理技術(shù)的發(fā)展。您只需要升級到JCB基于瀏覽器的圖像顯示工具JCB DataViewer (http://jcb-dataviewer.rupress.org)，就可以取得這些公共數(shù)據(jù)資源用于研究。
早在細胞生物學的初期，電鏡就幫助人們揭示了細胞的精細結(jié)構(gòu)。不過這一技術(shù)也存在局限，因為高分辨率電鏡觀察只能在一張圖像中捕捉到細胞的一小部分，使研究人員很難將觀察到的結(jié)構(gòu)與細胞整體關(guān)聯(lián)起來，更不必說細胞所處的組織或器官了。而另一方面，以較低的分辨率觀察樣品能得到細胞或組織的較大圖像，但又不能同時觀察到精細的亞細胞結(jié)構(gòu)。
現(xiàn)在Leiden大學醫(yī)學中心的Frank G.A. Faas等科學家們解決了這一問題，他們開發(fā)了新工具將成千上萬的電鏡圖像結(jié)合在一起形成了生物組織的高分辨率圖像，人們可以通過新版JCB DataViewer查看他們的數(shù)據(jù)。
研究人員將他們的新成果形容為“虛擬納米顯微鏡”，研究人員將超過26,000張圖像結(jié)合生成了近乎完整斑馬魚胚胎的十億像素級電鏡圖像，分辨率達到了每英寸一千六百萬像素。任何人都能使用JCB DataViewer將1.5毫米長斑馬魚胚胎的整體圖放大到各亞細胞結(jié)構(gòu)進行觀察。該文章發(fā)表在八月六日的JCB雜志上。
此外，研究人員還利用這一虛擬納米顯微鏡分析了內(nèi)皮細胞多糖復(fù)合物在腎小球濾過膜蛋白滲漏中的作用，對溶瘤呼腸孤病毒在人樹突細胞中的內(nèi)化進行了金標研究，并對完整的小鼠胚胎細胞進行了冷凍電鏡研究。
這一研究成果整合了跨細胞和組織的信息，將能為細胞生物學研究帶來難得的機遇。由于這種大型圖片很復(fù)雜，要獲得Faas等人的研究數(shù)據(jù)必須要升級到JCB DataViewer。這是JCB發(fā)布于2008年的瀏覽器圖像平臺，旨在促進其發(fā)表文章中的原始數(shù)據(jù)分享。
“實驗中既然成像了，就應(yīng)該要發(fā)表，”JCB主編Liz Williams說。作為一個雜志，“JCB將繼續(xù)致力于開發(fā)前沿工具，以便將推動細胞生物學領(lǐng)域發(fā)展的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出來?！?/SPAN>
