Nature子刊：癌癥單細胞測序新技術
日期：2012-07-24 08:28:29
只有通過近距離觀看修拉（Seurat）的繪畫，你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點，從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似，生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜，然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。
發布在7月22日《自然生物技術》（Nature Biotechnology）雜志上的一項新研究首次表明一種稱為Smart-Seq的新基因組測序方法可以幫助科學家們深入分析臨床相關的單細胞。Smart-Seq有許多可能的應用，包括幫助科學家們更好地了解腫瘤形成的復雜性。這非常的重要因為許多臨床上重要的細胞僅少量存在，需要進行單細胞分析。這項研究由來自美國路德維格癌癥研究學會、瑞典卡羅琳斯卡醫學院、加州大學圣地亞哥分析和Illumina Inc的研究人員組成的一個研究小組完成。
美國路德維格癌癥研究學會研究人員、瑞典卡羅琳斯卡醫學院細胞和分子生物學系課題組長、生物醫學科學家Rickard Sandberg 說：“雖然我們的結果是初步的，我們證明了開展個體的、臨床相關的細胞研究是有可能的。世界各地的癌癥研究人員現在能夠更系統地分析這些細胞，使得他們能夠在未來生成更好的診斷和治療方法。”
以往的研究表明通過原拷貝不同剪切和粘貼配置，一種基因生成同一蛋白的幾種形式是非常常見的。這種現象就稱之為剪接（splicing），表明來自相同組織的細胞并非如從前認為的那樣同質。
研究小組現在將研究向前推進了一步，開發出了一種方法可完整繪制單個細胞基因表達圖譜。在顯示哪些基因活性表達的同時，現在還有可能準確描述和研究來自相同組織的單個細胞間的基因表達差異。
Sandberg說：“科學家們在很長的時間里一直在等待這樣一種方法出現，但是技術局限使得難于生成足夠敏感和強大的方法。新方法具有幾個方面的應用包括癌癥研究，可用于研究在個體患者中哪些細胞類型形成了癌性腫瘤。”
在這項研究中，科學家們研究了復發性黑色素瘤患者血液系統中的腫瘤細胞。一旦他們在常規血液檢測中鑒別出腫瘤細胞，研究小組就采用Smart-Seq來分析它們的基因表達。通過這種方法，研究人員能夠證實腫瘤細胞激活了許多重要的膜蛋白，這些膜蛋白被認為對它們能夠逃避機體監控細胞，在血液或淋巴中擴散負責任。
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