中科院PNAS發表測序新成果
日期：2012-07-11 08:17:03
來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所、深圳湖大基因研究所、美國伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校和美國普渡大學的研究人員聯合發表了題為“Insights into salt tolerance from the genome of Thellungiella salsuginea”的論文，解析了鹽芥基因組序列及其耐鹽機制。相關成果發表在《美國科學院院刊》（PNAS）上。
來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物基因組學國家重點實驗室的謝旗研究員、王秀杰研究員、陳受宜研究員、儲成才研究員和深圳華大基因基因研究院王俊研究員、美國伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校的Han Bohnert教授以及美國普渡大學朱健康教授為該篇論文的共同通訊作者。王秀杰課題組的吳華君博士和謝旗課題組的張鐘徽博士等七位研究人員為該論文的共同第一作者。
對高等植物非生物脅迫應答的分子機制的研究具有重要的意義.擬南芥是一種典型的甜土植物,它在耐鹽耐旱面有其自身的局限性.鹽芥是擬南芥的近緣種，是一種高度耐鹽耐旱的鹽生植物。鹽芥具有作為模式植物的一系列良好特征，如個體較小、生活周期短、自花授粉、種子量大、基因組較小，而且易于轉化。,已成為人們研究植物非生物脅迫響應的模式植物。
在這篇文章中，研究人員成功解析了鹽芥的全基因組序列，并找到了一些鹽芥耐受極端環境機制的一些線索。研究人員突破性地利用一種層級拼接方法對Illumina GA II測序技術所得到的短序列進行了成功的拼裝，將其中80%的序列整合到鹽芥的7條染色體上。進化分析顯示，鹽芥和擬南芥大約分化于700萬到1200萬年之前。分化后的鹽芥基因組獲得了大量的轉座子序列，約占其全基因組序列的52%，這一比例是擬南芥的4倍。結合基因結構、序列同源性及表達信息等數據，研究組預測到鹽芥基因組存在編碼蛋白基因28,457個，其中大部分基因都與擬南芥具有一定的同源性。更細致的分析發現，與擬南芥相比鹽芥存在更多的“應激響應”基因，這些基因通過大片段基因加倍和基因串聯加倍兩種基因加倍事件而得到加倍。進一步的比較基因組學和實驗分析顯示，更多的葉表面蠟質、更強的離子轉運和更快的ABA響應等過程使得鹽芥具有更好的高鹽耐受性。
新研究完成了對鹽芥全基因組序列測定，對深入了解植物耐受非生物脅迫響應分子機制，改良培育高產優質、抗逆的農作物新品種，以及為國家糧食安全具有重要的意義。
上一篇： 首都醫科大學PNAS新文章
下一篇： 水解蛋白并無多大價值
