Science子刊：外顯子組測序個體化醫療應用
日期：2012-06-18 07:53:57
在6月13日的《科學轉化醫學》（Science Translational Medicine）雜志上，由加州大學圣地亞哥醫學院的研究人員領導的一個國際研究小組報告稱新的外顯子組測序（exome sequencing）技術不僅成為了鑒別致病基因的一種有前景的方法，也可能改善診斷及指導個體化患者醫療護理。
在外顯子組測序中，研究人員選擇性地同時靶向和定位基因組的所有外顯子區域。蛋白質是生物學的主力因子參與幾乎所有的細胞功能，肩負各種結構或功能職責。而外顯子是基因中轉錄生成蛋白質的關鍵性短DNA序列。
在加州大學圣地亞哥分校神經科學和兒科教授、首席研究員Joseph G. Gleeson博士的帶領下，研究人員對118位確診患有特異神經發育疾病的患者進行了外顯子組測序。在每個病例中，他們疾病所有已知的遺傳原因先前均被排除。
并不奇怪的是，科學家們發現外顯子測序新確定了許多的致病基因，包括確定EXOC8基因是一種累及發育小腦的Joubert綜合征的病因，GFM2是一種導致小型腦和小兒糖尿病的疾病的病因。
而更令研究人員驚訝地是，他們發現在大約10%的病例中，外顯子組測序導致確定了一個已知的致病基因，提示某些患者的疾病診斷和治療將發生改變。
Gleeson 說：“最初，我們驚訝地發現一些已知引起了人類疾病的基因突變，因為基于患者的診斷我們此前排除了這些已知的病因。當我們重新回到患者處解析曾經發生的事情時，我們確定在每個病例中，最初的診斷與基因診斷并不一致。這發生在大約10%我們研究的病例中，雖然患者是根據標準臨床實踐來進行診斷的。”
研究人員發現每個病例的基因診斷是完全正確的，通過仔細查閱患者病歷，確定了最初的診斷是錯誤的。“如果我們這些結果延伸到這些診所中所見的一般群體。我們可以推斷出通過先進的遺傳檢測大量的患者的診斷和治療都有可能被修改。”
Gleeson說這些不一致的原因是多方面的，并不反映醫學診斷的錯誤——至少研究小組沒能發現。相反，他說差異突顯了獲得特異診斷的固有困難，尤其是鑒于腦發育和功能的復雜性。
文章的第一作者、Gleeson實驗室成員Tracy Dixon-Salazar博士說這些研究結果提供了證明臨床外顯子組測序是可以用于診斷疾病的有價值的工具，尤其是對于那些預后不良、治療有限的神經發育障礙患者。
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