Nature子刊:解析miRNA生成調控機制
日期:2012-06-14 07:58:16
MicroRNAs (miRNAs) 是真核生物中廣泛存在的一種長約21到23個核苷酸的RNA分子,可調節其他基因的表達。miRNA來自一些從DNA轉錄而來,但無法進一步轉譯成蛋白質的RNA(屬于非編碼RNA)。
這些RNA從初級轉錄本(primary transcript),也就是pri-miRNA,轉變成為稱為miRNA前體(pre-miRNA)的莖環結構,最后成為了具有功能的miRNA。細胞借助于一種特殊的機器——“微處理器”復合物("Microprocessor" complex)將這些長鏈的miRNA前體切斷,然后將它們轉變為較短的功能性的miRNA形式。生成的miRNAs與特異性信使RNA(mRNA)分子結合,抑制轉錄后基因表達,在調控基因表達、細胞周期、生物體發育時序等方面起重要作用。在動物中,miRNAs通常可以調控成百上千不同基因的表達。
然而微處理器復合物也可以切斷其他類型的RNA,例如mRNAs,這些mRNAs有時會生成與miRNAs靶位點相似的不穩定結構。裂解這種錯誤的RNAs有可能對生物體帶來災難性后果。
在近期發布在《自然結構與分子生物學》(Nature Structural and Molecular Biology)雜志的一篇論文中,來自魏茨曼科學研究所分子遺傳學系的Eran Hornstein博士、Naama Barkai教授和前博士生Omer Barad與Mati Mann側重了解了這種微處理器在miRNAs生成中平衡有效性和特異性之間相互作用的機制。“一方面,它不應該過于有效,因為這可能會導致裂解不必要的非特異性RNA底物為代價。另一方面,也不應該太‘嚴格’因為過度的特異性會帶來不充分加工真正miRNAs的風險,”Hornstein說。
在一個跨學科研究項目中,科學家們利用數學建模確定了微處理器系統的特征,然后在細胞中測試了它們的理論。他們預測有效性和特異性之間的平衡是通過一個反饋回路維持,在這個反饋回路中微處理器檢測到細胞內可用pre-miRNA的數量,相應地改變自身的生產。
在小鼠和人類組織中檢測這一假說,研究人員能夠證實微處理器確實調控了miRNA前體的水平,當細胞充滿miRNA前體時則提高自身的生產,或在前體量下降時作出反應停止生產。這是通過消化一種在結構上與miRNA相似的Dgcr8 mRNA而實現的。通過與miRNAs維持水平一致,微處理器由此減少了切斷靶RNAs的機會。
由于合成小RNAs是對于多種疾病一種可能的新療法,這一研究或可直接促成未來有效的治療。此外,許多其他的生物系統需要兼顧有效性和特異性,該研究小組的結果表明許多可能是以相似的方式來實現的。
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