首次膽管癌綜合性基因組研究
日期：2012-05-16 08:15:19
一個跨國科學(xué)家團隊在研究膽管癌（致死型肝癌）的誘因時取得突破性進展。研究者發(fā)現(xiàn)了膽管癌中頻繁突變的一些新基因，為更好的了解膽管癌鋪平了道路。他們的這項研究發(fā)表在Nature Genetics的網(wǎng)站上。
膽管癌或Cholangiocarcinoma（CCA）是一種預(yù)后不良的致死型癌癥。在世界范圍內(nèi)的所有原發(fā)性肝癌中占10-25%，膽管癌在東南亞尤其是泰國東北部很普遍，每年新增約20,000病例。膽管癌在泰國發(fā)生率高，是由于當(dāng)?shù)鼐用耖L期食用感染了肝吸蟲（魚類寄生蟲，通過食物傳染）的生魚。肝吸蟲感染在泰國東北部相當(dāng)普遍，被認為有超過6百萬人受到感染。一旦食用了肝吸蟲，這些寄生蟲會在人類宿主的膽管聚集，引起持續(xù)感染并最終導(dǎo)致癌癥。
研究團隊由NCCS-VARI Translational Cancer Research實驗室的Bin Tean Teh博士領(lǐng)導(dǎo)。VARI和NCCS于2007年在新加坡設(shè)立NCCS-VARI Translational Research研究項目。該項目主要針對患有特定癌癥的亞洲和非亞洲病人，研究他們藥物反應(yīng)的差異及其背后的生物學(xué)機理。
該團隊還包括Patrick Tan副教授、Steve Rozen副教授（都來自新加坡Duke-NUS醫(yī)學(xué)院）以及泰國Khon Kaen大學(xué)的Vajarabhongsa Bhudhisawasdi教授。這項突破性研究歷時兩年，其間新加坡科學(xué)家造訪泰國北部村莊，泰國研究者來到新加坡NCCS實驗室進行研究。
Teh教授說，這項研究為深入了解這些新基因在膽管癌中的作用打下了基礎(chǔ)。
“這項研究加深了我們對膽管癌的了解。”Teh教授說，“更重要的是發(fā)現(xiàn)了新基因及其在膽管癌中的影響，目前需要進一步研究它們的生物學(xué)特性來確定這些基因如何引起膽管癌。”
研究人員通過全外顯子測序（whole-exome sequencing）分析了八個泰國病人的膽管癌組織和相應(yīng)正常組織，發(fā)現(xiàn)了187個基因上的206個體細胞突變，并從中選取了15個基因在額外46個CCA病例中進行突變率篩查。除了已知的膽管癌相關(guān)基因TP53（突變率44.4%）、KRAS（突變率16.7%）和SMAD4（突變率16.7%），研究人員在10個新發(fā)現(xiàn)的癌基因上也發(fā)現(xiàn)了體細胞突變somatic mutations（突變率14.8–3.7%）。其中包括MLL3 （突變率14.8%）、ROBO2（突變率9.3%）、RNF43（突變率9.3%）和 PEG3 （突變率5.6%）的失活性突變，以及GNAS 致癌基因（突變率9.3%）的激活性突變。這些基因可以從功能上被分為三類：使組蛋白修飾子（histone modifier）失活；激活G蛋白信號通路；降低基因組穩(wěn)定性。
“這項研究使我們對膽管癌的分子機制了解得更為深入，為確定最佳治療方案提供了新治療方法。而這可能在泰國拯救許多生命，”泰國Khon Kaen 大學(xué)肝吸蟲和膽管癌研究中心的主任Vajarabhongsa Bhudhisawasdi教授說。“同時，這項研究顯示我們能通過國際合作，分享專業(yè)知識和經(jīng)驗，共同改善人類生活。”
研究團隊也將膽管癌和其他肝臟/胰腺相關(guān)癌癥進行了對比。令人驚訝的是，研究人員發(fā)現(xiàn)膽管癌與胰腺癌有一定的相似之處。
“該研究提供了一個強有力的研究方向，”Duke-NUS腫瘤與干細胞生物學(xué)項目的副教授Patrick Tan說“比起此前的研究成果，膽管癌與胰管癌在本研究中表現(xiàn)出更多的分子相似性，說明這兩種癌癥之間存在通用的生物學(xué)路徑。研究這這些路徑，我們將得到腫瘤發(fā)展的更多信息。”
參與該研究項目的一位泰國科學(xué)家Chutima Subimerb說，她很高興能參與這項國際健康項目。“我們很榮幸能和新加坡的Teh教授及其他科學(xué)家一同合作。通過整合各自資源，我們得以完成這項有著廣泛影響的研究。這項研究對那些一直從池塘和河流中捕魚并食用的窮人特別有意義。我相信這只是第一步，未來在科研領(lǐng)域我們將會有更多的合作。”
