美國國立衛(wèi)生研究院“冷對”基因數(shù)據(jù)隱私新挑戰(zhàn)
日期：2012-04-16 09:03:08
本周發(fā)表的一篇極具“挑釁性”的論文提到，研究人員找到一個方法可以連接一個人的基因到某一公共研究數(shù)據(jù)庫里其匿名的基因數(shù)據(jù)上。但是，美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）作為最大的此類數(shù)據(jù)庫的擁有者之一，表示不打算采用任何新步驟預(yù)防某些人利用這種辦法破壞基因隱私。這與NIH四年前的反應(yīng)形成鮮明對比，當(dāng)時，一個相類似的研究促使它將基因數(shù)據(jù)從其公共網(wǎng)站中取了出來。
那時，NIH將來自于數(shù)百人的單核苷酸多態(tài)性（SNP）數(shù)據(jù)張貼在了網(wǎng)上，以為不會破壞隱私。但是，隨后有科學(xué)家在《公共科學(xué)圖書館—遺傳學(xué)》（PloS Genetics）上發(fā)表文章指出，如果他們有某個人的DNA樣本，他們可以在一個公共DNA數(shù)據(jù)庫中連接到該人的SNP結(jié)果。如此一來，NIH和維康基金會不得不將這些數(shù)據(jù)從公共網(wǎng)站上撤了下來。現(xiàn)在，NIH只允許通過認證的研究者下載這些SNP數(shù)據(jù)。
對于特殊類型的基因數(shù)據(jù)而言，這種準入壁壘并不常見，例如通過研究組織樣本中的RNA水平分析測量基因活性。因為這類基因表達數(shù)據(jù)被認為不是起源于某個人，研究人員已經(jīng)定期存放RNA結(jié)果到公共數(shù)據(jù)庫中，例如，NIH的基因表達綜合（GEO）數(shù)據(jù)庫。
但是，紐約市西奈山醫(yī)學(xué)院的Eric Schadt和同事在《自然—遺傳學(xué)》（Nature Genetics）發(fā)表的論文提到，他們發(fā)現(xiàn)了生成基于個體的基因表達結(jié)果的個人SNP“主頁”，或一個DNA“條碼”的方法。這就意味著，原則上講，如果有人有一個儲存在GEO參與者的DNA樣本，他將能夠設(shè)計出一個SNP條碼，用它來與GEO樣品進行匹配，尋找參與者的生物數(shù)據(jù)。
盡管與2008年PloS Genetics發(fā)表的論文相似，但是NIH此時并未憂慮。NIH的一份聲明提到，NIH認為不需要改變自己的數(shù)據(jù)共享模式。美國國家人類基因組研究所發(fā)言人Larry Thompson解釋道，Schadt團隊需要極為復(fù)雜的統(tǒng)計工具，并且這不是一個簡單的事情。Schadt則并不期望NIH采取新的數(shù)據(jù)訪問限制，而是希望強調(diào)，事實上可能沒有方法能夠完全保證個人基因數(shù)據(jù)安全。
