Nature：大規模繪制乳腺癌基因組
日期：2012-04-09 08:24:21
近日來自加拿大英屬哥倫比亞國際大學、西蒙菲莎大學和南加州大學等研究機構的科學家們組成的一個國際研究小組開展了史上最大規模的三陰性乳腺癌(triple negative breast cancer, TNBC)遺傳分析研究，他們通過對超過100種三陰性乳腺癌的腫瘤樣品繪制基因組，解開了這種最致命的乳腺癌的遺傳密碼，揭示了該疾病難于治療的根源。相關研究論文發表在4月4日的《自然》（Nature）雜志上。
三陰性乳腺癌是指雌激素受體(ER)、孕激素受體(PR)和人表皮生長因子受體2(Her-2)均為陰性的乳腺癌。主要好發于40以下的婦女，約占乳腺癌患者總數的16%，乳腺癌死亡總數的25%。由于采用現代藥物治療效果不佳，科學家們將其視為最具致命性的乳腺癌形式。
該研究的領導者Sam Aparicio表示新研究表明三陰性乳腺癌并非僅是一種乳腺癌亞型，實際上它非常的復雜。
起初，59位科學家希望通過繪制104種腫瘤基因組找到它們之間的相似基因譜（gene profiles）。然而令他們感到驚訝的是，他們發現沒有任何兩個基因組是相似的，更不用說相同。
在這篇文章中，研究人員發現這104種TNBC顯示了廣泛和連續的基因組進化譜。一些僅包含少數的編碼體細胞畸變，而另一些則包含了數百個的編碼體細胞突變。高通量RNA測序(RNA-seq)揭示大約只有36%的突變得到表達。利用深度再測序（deep re-sequencing）測量2,414個體細胞突變的等位基因豐度，研究人員第一次確定了腫瘤樣品間克隆頻率的相對豐度，分析結果表明TNBCs克隆頻率差異頗大。
“在分子水平上檢測這些腫瘤讓我們知道所處理的并非是一種乳腺癌亞型，而是一系列不同的乳腺癌類型，”文章的共同作者、西蒙菲莎大學分子生物學和生物化學教授Steven Jones說。
Steven Jones補充說：“盡管它們在臨床上相似，然而卻顯示出遺傳多樣性，這或可解釋為什么這類疾病難于治療。這些研究發現證實了個體化癌癥藥物治療的重要性，靶向特定腫瘤的基因結構而非單一治療更適合于治療多種看起來相似的腫瘤。”
卑詩癌癥機構(BC Cancer Agency) Samuel Abraham博士說該研究強調了個體化癌癥藥物治療的重要性。“通過準確區分不同類型三陰性乳腺癌，可能使我們具備解析復雜性的能力。從而為我們提供了一個潛在治療這一疾病的把手，”Abraham說。
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