基因組測(cè)序法可追查疫情暴發(fā)路徑
日期：2012-03-01 08:38:01
據(jù)報(bào)道，由哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院和布洛德研究所共同組成的一個(gè)研究小組，利用全基因組測(cè)序已經(jīng)追查到去年在歐洲大范圍致病的大腸桿菌（E.coli）暴發(fā)路徑。相關(guān)研究結(jié)果提前刊登在近日美國(guó)《國(guó)家科學(xué)院院刊》在線版上。
這是第一個(gè)采用基因組測(cè)序的方法來(lái)研究食源性暴發(fā)的動(dòng)態(tài)，由此為了解未來(lái)疫情和傳染病的出現(xiàn)和蔓延提供了新途徑。這項(xiàng)研究的合作者還包括法國(guó)巴斯德研究所、丹麥國(guó)立血清研究所等。
在生物學(xué)中，一個(gè)生物體的基因組是指包含在該生物的DNA（部分病毒是RNA）中的全部遺傳信息。確定哪些DNA變異導(dǎo)致特定性狀或疾病則需要進(jìn)行個(gè)體間比較。該研究的主要作者、傳染性疾病動(dòng)態(tài)中心研究者永納坦·格拉德說(shuō)，尋找疫情暴發(fā)的多種細(xì)菌的基因組之間的差異，即可得到疫情發(fā)生的線索。像做偵探工作一樣，研究人員通過(guò)這種方式跟蹤疫情，可了解未來(lái)疾病暴發(fā)路徑。
去年夏天在德國(guó)，因大腸桿菌病毒的肆虐成千上萬(wàn)人生病，50多人死亡，之后在法國(guó)也引起了小范圍的暴發(fā)。研究人員將這兩國(guó)的致病大腸桿菌株對(duì)比分析，發(fā)現(xiàn)菌株相同。然而，利用全基因組測(cè)序分析菌株之間的差異時(shí)，研究人員發(fā)現(xiàn)：所有與德國(guó)當(dāng)?shù)叵嚓P(guān)暴發(fā)的菌株都幾乎是相同的，而出現(xiàn)在法國(guó)菌株表現(xiàn)出更大的多樣性，顯示出是從德國(guó)菌株分離出來(lái)的一個(gè)子集。
隨著基因組測(cè)序成本的下降，未來(lái)將其與傳統(tǒng)的流行病學(xué)方法相結(jié)合，可以為人們對(duì)傳染病的出現(xiàn)及蔓延提供更深入的了解，將有助于指導(dǎo)公共衛(wèi)生預(yù)防措施。
