《Cell》文章揭示腫瘤與染色體重排新機制
日期：2012-02-02 08:43:54
來自歐洲分子生物學實驗室EMBL，海德爾堡德國癌癥研究中心DKFZ等處的研究人員發表了題為“Genome Sequencing of Pediatric Medulloblastoma Links Catastrophic DNA Rearrangements with TP53 Mutations”的文章，報道了大規模的復雜染色體重排，并提出一種基因突變和染色體碎裂之間的聯系，為解析某些特定的惡性癌癥亞型的遺傳基礎提供了重要信息，相關成果公布在Cell雜志上，并被作為重點文章推薦。
文章的通訊作者是德國癌癥研究中心Peter Lichter, Stefan M. Pfister，以及Jan O. Korbel。其中Lichter教授長期從事癌癥研究，曾在腫瘤生長途徑等多方面獲得重要成果，并擔任《國際癌癥期刊》主編。
傳統理論認為癌癥是人體經歷成千上萬次的細胞突變后，慢慢演化的結果。但是去年來自桑格研究所的研究人員通過測序研究750個腫瘤的遺傳缺陷，發現當一次細胞危機引起幾十個或數百個基因組重排時有可能會導致癌癥突發。
這750個病例中大部分的案例都與傳統理論相符，染色體的損壞是常年累積的結果。然而，其中至少有1/40的腫瘤不符合“標準模式”，有的染色體似乎是在一夜之間遭到破壞的。這也解釋了為什么有些人在體檢時根本沒發現癌癥痕跡，但數月后突然就被診斷患上這種疾病了。
在這篇文章中，研究人員對一種髓母細胞瘤樣品進行了全基因組測序分析，結果發現了大規模的復雜染色體重排，這個樣品來自于一個攜帶生殖細胞系TP53突變（Li- Fraumeni綜合征）的病人的大腦腫瘤。
研究人員再把來自更多病人的基于芯片和深度測序為基礎的DNA重排數據與TP53狀態進行整合分析，從而揭示了SHH-MBS中P53突變和染色體碎裂之間的顯著關聯。另一方面，研究人員通過額外的腫瘤個體分析也證實了TP53基因突變和染色體碎裂之間的聯系，并顯示了p53在災難性的DNA重組中扮演著一個特定背景下的角色。
除此之外這一研究還在急性髓細胞性白血病中觀察到了TP53突變與染色體碎裂之間的強關聯性。這些研究結果在特定類型的腫瘤中，把p53狀態和染色體碎裂“chromothripsis”聯系起來，為某些特定的惡性癌癥亞型的遺傳基礎的理解提供了線索。
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