全基因組測序助力Nature癌癥研究重大發(fā)現(xiàn)
日期：2012-01-13 08:53:00
來自圣猶大兒童研究醫(yī)院，華盛頓大學醫(yī)學院等處的研究人員發(fā)表了題為“The genetic basis of early T-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia”的文章，利用全基因組測序方法，分析了一種重要兒童白血病的遺傳機制，并提出了一種有助于該疾病治療的新型定向治療方案。這是首次針對兒童癌癥基因組分析，獲得的系列重大成果。相關成果公布在Nature雜志上。
文章的通訊作者是圣猶大兒童研究醫(yī)院病理系的James R. Downing和Charles G. Mullighan，這一研究組曾通過對242名患者基因組的350,000個位點進行了掃描，發(fā)現(xiàn)了一個與急性淋巴性白血病相關的重要突變。對于這一最新的研究，Mullighan博士表示，“我們發(fā)現(xiàn)的這個基因表達譜突變說明，患有這種兒童白血病的病人也許能通過急性髓系白血病相關的治療藥物獲得緩解。”
起源于早期前體T細胞（ETPs）的急性淋巴細胞白血病（acute lymphoblastic leukaemia，ETP ALL）是一種兒童白血病的獨特生物次類型，這一疾病是由圣猶大兒童研究醫(yī)院的研究人員發(fā)現(xiàn)，大約占T-ALL中12%的比例。目前的治療方法對許多罹患ETP-ALL的病人不起作用，無法進入緩解期，只有大約30%-40%的病人能成為長期幸存者。
這項研究中，研究人員測序分析了12位圣猶大ETP-ALL病患的基因組，以及健康對照組的基因組，而且還在另外94位患有ETP-ALL或者其它類型的T細胞ALL小患者樣品中，篩查同樣的突變。
結(jié)果他們發(fā)現(xiàn)了只在ETP-ALL病患樣品中出現(xiàn)的突變，這將研制這一疾病的遺傳檢測識別方法，以及治療新靶標提供了依據(jù)，也有助于開發(fā)更積極的定向治療方法。
研究人員也發(fā)現(xiàn)，這些突變主要是出現(xiàn)在調(diào)控細胞因子受體和Ras信號作用通路的基因中，這些基因突變很多是因為染色體重排而出現(xiàn)的，而這樣的重排產(chǎn)生新的嵌合式融合基因，這些突變會被高頻率激活，而組蛋白修飾基因中的突變則被高頻率鈍化。這種突變模式與惡性骨髓瘤的突變模式相似，說明以骨髓為目標的治療方法，比如能夠抑制細胞因子受體和JAK信號作用的高劑量“阿糖胞苷”定向療法，對于治療ETP-ALL也許會有效。
圣猶大科學部主任William E. Evans博士表示，“這是兒童癌癥基因組計劃，首次針對兒童癌癥基因組分析的系列重大發(fā)現(xiàn)，這一計劃將于2013年完成600個兒童基因組序列的測定。”
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