新技術同時檢測基因和蛋白表達
日期：2011-09-28 10:26:54
據報道，美國俄亥俄州立大學的研究人員近日開發出一種新技術，能同時觀察細胞中的基因數量和蛋白表達。此技術能夠詳細分析基因狀態以及相應蛋白表達之間的關聯，并更透徹地了解癌癥及其他復雜疾病。該成果發表在《Neuro-Oncology》上。
這種新技術稱為熒光原位基因蛋白分析（fluorescent in situ gene protein assay）。它將傳統的熒光原位雜交（FISH）與原位鄰位連接分析（in situ proximity ligation assay，簡稱PLA）相結合。
PLA分析采用核酸適體（aptamer）或單/多克隆抗體-核酸復合物作為鄰位連接探針。當一對鄰位探針同時識別同一個目標蛋白分子時，它們將在空間位置上相互臨近，通過連接反應形成一段可擴增的DNA標簽序列，該標簽序列能夠反映待測蛋白的種類及濃度。
文章的作者之一，俄亥俄州立大學的Arnab Chakravarti博士表示：“據我所知，這是目前第一個技術，能讓我們了解同一細胞中的基因活性和相應蛋白表達。了解腫瘤中的基因和蛋白表達變化，有助于我們了解是什么驅動了腫瘤行為。”
文章的通訊作者，亞拉巴馬大學副教授Markus Bredel及其同事首先分析了固定的人膠質母細胞瘤細胞，然后分析了石蠟包埋的人膠質母細胞瘤組織。在這兩個分析中，他們都發現了一種表皮生長因子受體基因的突變形式（EGFRvIII）的過表達，并在膠質母細胞瘤中發現了截短蛋白。
他們認為，這種方法有潛力詳細分析細胞和組織中癌基因狀態及相應蛋白表達之間的關聯。他們表明，熒光原位基因蛋白分析能夠在細胞水平分辨癌基因和蛋白，這對于異質性疾病（如癌癥）特別重要。
因表觀遺傳學和轉錄后調控的作用，這種方法對癌癥研究很有用。它將基因和蛋白信息相關聯，能提高生物標志物篩選的可靠性。它還能輔助治療決策，因為有時只篩選基因或蛋白產生了不確定的結果。
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