研究解析獼猴全基因組序列多態性
日期：2011-07-14 08:15:43
獼猴是人類的近親，也是在研究中最廣泛使用的非人靈長類模式動物。雖然獼猴在生物學和醫學方面的應用已經有很長的時間，但人們對獼猴基因組序列多態性的了解卻非常有限。
中國科學院昆明動物研究所宿兵實驗室（博士研究生張雁峰等）和華大基因合作，采用二代測序的方法對中國獼猴進行了全基因組序列分析。測序深度為獼猴基因組11.56倍的覆蓋率。通過和國外已測的印度獼猴基因組序列的比較，他們共發現了550萬個單核苷酸序列多態性位點（SNP），其中294萬個SNP是中國獼猴基因組中的雜合多態性，256萬個SNP是中國獼猴和印度獼猴間的差異位點。同時，他們還發現了12萬多個的基因組結構變異（Structural variation, SV）。
這項工作是首次對獼猴全基因組序列多態性的解析，所報道的海量序列多態數據將為以獼猴為對象的生物學和臨床前醫學研究提供具有重要價值的數據庫。相關研究結果發表于基因組學的知名刊物《基因組生物學》（Genome Biology）。
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