我國科學(xué)家完成大黃魚基因組序列圖譜繪制

日期：2011-02-09 15:57:56

由來自浙江海洋學(xué)院、復(fù)旦大學(xué)、上海交通大學(xué)等院所的科學(xué)家組成的大黃魚基因組計劃項目小組已繪制完成大黃魚的全基因組測序、組裝和序列圖譜，這是我國完成的第二個魚類基因組序列圖譜，也是世界上首個石首魚科魚類基因組序列圖譜。

大黃魚屬硬骨魚綱,鱸形目、石首魚科、黃魚屬,是我國特有的名貴優(yōu)質(zhì)魚類,曾列中國四大海洋漁業(yè)對象之首位,被譽為“中國國魚”。歷史上大黃魚年產(chǎn)量最高近20萬噸。由于多年酷漁濫捕,自然資源已近枯竭。近年來,養(yǎng)殖大黃魚種質(zhì)退化、病害頻發(fā)、性早熟嚴重、生長和抗逆性能降低等,更是困擾著大黃魚產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。要從根本上解決這些問題,必須對大黃魚基礎(chǔ)生物學(xué)進行深入研究,從基因、基因組等不同層面對大黃魚生長、抗逆、性成熟等相關(guān)性狀及其機理進行解析,揭示大黃魚的生命奧秘,為推動大黃魚養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展奠定理論基礎(chǔ)。大黃魚全基因組的測定和序列圖譜的成功繪制,將會對大黃魚基礎(chǔ)生物學(xué)研究和大黃魚產(chǎn)業(yè)的發(fā)展產(chǎn)生深遠的影響。

項目組專家，上海交通大學(xué)劉赟副教授說，研究結(jié)果表明，大黃魚基因組包含４８條染色體，比人類多兩條，全基因組大小在７５０Ｍ左右，相當(dāng)于人類的四分之一。

“一個物種基因組計劃的完成，標志著對這一物種生命密碼天書進行人工編輯時代的到來，意味著這一物種學(xué)科和產(chǎn)業(yè)發(fā)展的新開端。”該項目負責(zé)人、浙江海洋學(xué)院副校長吳常文教授說。

大黃魚全基因組的測定和序列圖譜的成功繪制，將會對大黃魚基礎(chǔ)生物學(xué)研究和大黃魚產(chǎn)業(yè)的發(fā)展產(chǎn)生深遠的影響。其中包括更深入地了解與大黃魚生產(chǎn)性狀如生長、抗病、耐寒等性狀的遺傳機制，為性狀改良和遺傳育種奠定基礎(chǔ)，快速開發(fā)出大黃魚部分疾病的有效藥物，通過基因工程手段生產(chǎn)對人類有益的生物活性物質(zhì)和海洋藥物等。

項目組同時表示，希望大黃魚圖譜作為一種公共資源，與致力于大黃魚研究和保護的研究人員共享，相關(guān)網(wǎng)站建設(shè)預(yù)計于２０１１年６月完成，屆時研究人員可以下載到大黃魚圖譜完整的數(shù)據(jù)庫。此外，項目組正籌劃進一步聯(lián)合開展其他典型海洋生物全基因組序列圖譜研究,相信隨著這些工作的相繼開展,將大大推動我國海洋生物基因組學(xué)的發(fā)展,使我國海洋生物學(xué)的研究真正進入基因組時代。此項工作是高校產(chǎn)學(xué)研用結(jié)合的一項典范,新成立的“海洋生物基因組研究中心”就此吹響了向海洋生物世界進軍的號角。