科學家發現與肺癌相關的基因突變
日期：2010-09-17 14:30:30
文章的通訊作者是Genetech公司的張澤民(Zemin Zhang，音譯)博士，其早年畢業于南開大學，之后獲得賓夕法尼亞州立大學博士學位，主要研究興趣是癌癥基因組學，其研究組利用計算機方法嘗試預測疾病基因突變。
全球每年由于吸煙導致肺癌的病例數不勝數，在工業發達國家如美國等，肺癌的發病率占常見癌癥的首位，為第一位癌癥死亡原因。煙草中的致癌物如3，4-苯并芘、煙焦油等的致癌作用是一致公認的。
2010年1月，英國劍橋大學韋爾科姆基金會桑格學院的研究人員利用大規模高通量測序技術，對小細胞肺癌細胞系：NCI-H209進行了測序分析，發現了與吸煙有關的突變。他們發現了22910個候選因子，其中還包括了134個編碼外顯子。
而最新的這項研究發現了超過5萬個基因點突變，其中530個得到確認，它們當中392個在編碼區域，包括以前已知的變異，如KRAS“原致癌基 因”突變和放大。這些數據表明，遺傳上復雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變，而且要識別復發性致癌“驅動突變”(driver mutation)，將需要對很多尚未測序的樣本進行測序。
完整基因組測序為包括肺癌在內的若干種癌癥類型的突變譜提供了線索。在這篇文章中，研究人員從全基因組范圍內來觀察突變差異，他們對一名煙齡超 過15年，平均每天吸煙25根的原發性肺部腫瘤患者進行分析，將這名患者的癌細胞和相鄰正常組織的完整序列進行了比較。發現了多達5萬個基因突變，這一數 目非常龐大，過去從未有研究發現如此多的基因突變。
研究人員認為這可能和患者的煙齡有關，通過這一患者吸煙的數量和基因突變的比例來看，籠統來說就是每吸三根煙即可能產生一個基因突變。當然具體 的情況更為復雜，但是研究人員也指出，雖然人體的DNA修復機制能部分修復由于吸煙帶來的傷害，但是吸煙時間越長，這種機制功能就越差。
除此之外，研究人員還在這5萬個基因中找到了392個在編碼區域的突變，包括以前已知的變異，如KRAS原致癌基因突變和放大。這些數據表明，遺傳上復雜的腫瘤可能包含很多部分冗余的突變。
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