Nature子刊發(fā)布大腦表觀遺傳學(xué)重要圖譜
日期：2017-02-08 08:51:05
表觀遺傳修飾的重要性越來越被人們所認識，但在人類大腦中的作用并不是很清楚，實際上在胚胎和成人大腦中，神經(jīng)干細胞增殖并通過一些受到高度調(diào)控的過程生成神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)，包括DNA和組蛋白修飾以及非編碼RNAs調(diào)控在內(nèi)的表觀遺傳學(xué)機制在神經(jīng)發(fā)生的不同階段發(fā)揮至關(guān)重要的作用。另一方面異常的表觀遺傳調(diào)控也會導(dǎo)致各種腦疾病發(fā)生。
近期來自約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的宋紅軍（Hongjun Song）教授領(lǐng)導(dǎo)的研究組發(fā)布了最新成果：通過分析成體小鼠神經(jīng)元活性與染色質(zhì)可及性（）變化之間的關(guān)聯(lián)，構(gòu)建了新的大腦表觀遺傳學(xué)重要圖譜，這揭示了成體哺乳動物大腦中的染色體可及性的動態(tài)變化機制，并提出了一種表觀遺傳學(xué)機制，解釋了瞬間神經(jīng)元激活如何通過改變?nèi)旧|(zhì)可及性來引起基因表達的動態(tài)變化。
這一研究成果公布在2月6日的Nature Neuroscience雜志上，文章通訊作者為宋紅軍教授，其他研究人員包括明國麗（Guo-Li Ming）教授等人，這兩位學(xué)者是一對華人夫妻，共同在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域取得了許多重要的成就，聯(lián)合署名發(fā)表在Cell、PNAS、Nat Neurosci等國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊上。
染色質(zhì)是真核DNA的存在方式，可以通過影響DNA的可及性來調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄。研究表明神經(jīng)元活性誘導(dǎo)基因表達能調(diào)節(jié)神經(jīng)系統(tǒng)的功能和可塑性，但是至今科學(xué)家們?nèi)圆磺宄窠?jīng)元活性在哪種程度上會導(dǎo)致染色質(zhì)可及性發(fā)生變化，染色質(zhì)可及性正是基因表達表觀遺傳調(diào)節(jié)的一種主要模式。
在最新這篇文章中，研究人員利用ATAC-seq測序方法，通過轉(zhuǎn)座酶易接近染色質(zhì)比對了成體小鼠齒狀顆粒細胞神經(jīng)元在體內(nèi)發(fā)生同步神經(jīng)元激活前后染色質(zhì)可及性的變化，繪制出了新的大腦表觀遺傳學(xué)重要圖譜。
ATAC-seq測序方法是斯坦福大學(xué)的Howard Chang研究組2013年開發(fā)的一種利用高通量測序檢測轉(zhuǎn)座酶易接近的染色質(zhì)的技術(shù)，在ATAC-seq技術(shù)中，DNA標記(作為轉(zhuǎn)座子發(fā)揮作用)通過酶促反應(yīng)被整合到基因組的開放區(qū)域，然后通過測序，用來鑒定這些區(qū)域。
通過利用這一技術(shù)，研究人員發(fā)現(xiàn)了激活后1小時的全基因組變化，比如在活性增強子區(qū)域和AP1復(fù)合物（c-Fos）結(jié)合位點上出現(xiàn)了富集開放位點，有一些改變能持續(xù)至少24小時。研究人員還進行了功能分析，進一步發(fā)現(xiàn)了c-Fos在啟動，而不是維持神經(jīng)元活性誘導(dǎo)染色質(zhì)開放方面的關(guān)鍵作用。
這項研究揭示了成體哺乳動物大腦中的染色體可及性的動態(tài)變化機制，并提出了一種表觀遺傳學(xué)機制，解釋了瞬間神經(jīng)元激活如何通過改變?nèi)旧|(zhì)可及性來引起基因表達的動態(tài)變化。
此前，宋紅軍，明國麗等人還在Nature Reviews Neuroscience雜志上發(fā)表綜述，介紹了在認識神經(jīng)發(fā)生中表觀遺傳機制和其在腦疾病中異常調(diào)控方面取得的進展，包括對新發(fā)現(xiàn)的DNA胞嘧啶修飾進行了探討。他們還簡略地論及了新興的表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)（Epitranscriptomics）領(lǐng)域，這涉及mRNAs和長鏈非編碼RNAs的修飾。
