Cell文章揭示重要的lincRNA
日期：2016-07-18 08:56:46
麻省大學醫學院的一個科學家小組發現了，負責調控天然免疫的一種長鏈非編碼RNA：lincRNA-EPS。這項研究發布在《細胞》（Cell）雜志上。
在巨噬細胞中大量表達的lincRNA-EPS，將觸發炎癥的一些基因維持在關閉狀態直至遭遇到病原體。這一研究發現指出了lincRNAs在免疫系統中從前未知的一種作用，有可能促成對失控性免疫反應引起的一些炎癥疾病，如紅斑狼瘡或炎癥性腸病的新認識。
研究的資深作者、醫學教授Katherine A Fitzgerald說：“這些研究結果表明了一個尚未探索的控制炎癥和免疫反應的調控層面。我們已證實了一種lincRNA在免疫系統中發揮重要的功能。”
為了區別它們與microRNA、siRNA、piRNA和其他的小分子RNA，長鏈非編碼RNAs被定義為是長度大于200個核苷酸的一類非蛋白質編碼轉錄物。人們認為lincRNA可能控制了人類基因組中大多數的RNA轉錄。Fitzgerald說：“盡管它們含量豐富，當前對于這些長鏈RNAs在免疫系統中的功能所知甚少。免疫學家們在試圖了解控制免疫系統的復雜遺傳環路時，一直都將焦點放在基因組2%的蛋白質編碼區域上。”
利用缺失lincRNA-EPS的小鼠模型，Fitzgerald和同事們證實在正常狀態下，抵御感染的一種白細胞：巨噬細胞生成lincRNA-EPS阻止了自發性激活一些免疫反應基因。然而，當巨噬細胞檢測到一種潛在病原體時，lincRNA-EPS表達受到抑制松開這一剎車，啟動了促炎癥反應。缺失的lincRNA-EPS小鼠顯示細胞因子和炎癥反應水平增高，導致了中毒性休克。
研究人員發現lincRNA-EPS通過控制核小體的位置使得一些免疫基因無法接近，抑制了它們表達。當lincRNA-EPS不再在這些細胞中表達時，基因組結構發生改變，由此一些至關重要的免疫相關基因會暴露出來進行轉錄。當研究人員將lincRNA-EPS重新導入到巨噬細胞中時，免疫基因的表達會恢復至正常水平。
論文的第一作者、麻省大學醫學院博士后研究人員Maninjay K. Atianand說：“我們還發現lincRNA-EPS表達自身受到非常精細地調控，對于微小的改變非常敏感。這一lincRNA是阻止自發性激活關鍵免疫基因的這一分子回路中一個重要的組件。這些研究發現重要地暗示了lincRNAs在慢性炎癥和免疫病理變化中的潛在作用。
下一步Fitzgerald和同事們打算確定lincRNA-EPS在腸炎中所起的作用，以及它在豐富表達的結腸中發揮的功能。
中國醫學科學院北京協和醫學院的研究人員在新研究中揭示，在基因間長鏈非編碼RNA (lincRNA) LINC00673中的一個胰腺癌風險變異為miR-1231構建了一個結合位點，干擾了PTPN11降解。這一重要的研究發現發布在2016年5月23日的Nature Genetics雜志上。
斯坦福大學醫學院的研究人員發現，古代病毒感染留下的遺傳學物質lincRNA在人類發育過程中起到了非常關鍵的作用。受精的人類卵細胞需要這樣的非編碼RNA，才能在早期發育中獲得多能性。阻斷這些RNA分子的生產，發育就無法繼續進行。這項研究發表在2015年11月的Nature Genetics雜志上。
2015年10月，來自中科院昆明動物研究所、中國農業科學院的研究人員調查了來自3個豬品種脂肪和肌肉組織中全基因組范圍長鏈基因間非編碼RNA的DNA甲基化水平。研究結果發布在《Scientific Reports》雜志上。
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