華裔學(xué)者Nature綜述:lncRNA的獨(dú)特之美
日期:2015-12-29 09:15:17
幾乎整個(gè)人類(lèi)基因組都會(huì)轉(zhuǎn)錄成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白質(zhì)生產(chǎn)。科學(xué)家們逐漸意識(shí)到,非編碼RNA并不是基因組中的垃圾序列,而是許多基礎(chǔ)生命過(guò)程的核心,有著廣泛的生物學(xué)功能。然而,大多數(shù)RNA(非編碼轉(zhuǎn)錄組)的功能還是未知的,長(zhǎng)非編碼RNA就是其中之一。
長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)是長(zhǎng)達(dá)兩百個(gè)核苷酸以上的轉(zhuǎn)錄本,絕大多數(shù)位于細(xì)胞核內(nèi)。雖然lncRNA沒(méi)有編碼任何蛋白質(zhì),但它們?cè)诓煌M織和發(fā)育階段的表達(dá)依然具有特異性,這說(shuō)明lncRNA具有重要的生物學(xué)意義。在測(cè)序技術(shù)的幫助下,人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學(xué)功能依然還是個(gè)謎。
哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員日前在Nature Reviews Genetics雜志上發(fā)表文章,探討了lncRNA生成和功能的獨(dú)特之處。文章的通訊作者是哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院的華裔學(xué)者Howard Y. Chang。Howard Chang教授曾入選HHMI2009年早期職業(yè)科學(xué)家項(xiàng)目(2009 Early Career Scientist Program),獲得百萬(wàn)美元資助。這項(xiàng)計(jì)劃會(huì)在6年中為每一位入選科學(xué)家提供包括薪酬,福利和研究預(yù)算在內(nèi)的,超過(guò)150萬(wàn)美元的經(jīng)費(fèi)支持,這些科學(xué)家也會(huì)被聘為霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究院的全職研究員。近幾年Howard Chang教授多次在頂級(jí)期刊上發(fā)表重要成果。
人們最初發(fā)現(xiàn)lncRNA的時(shí)候,將其稱(chēng)為不編碼蛋白的mRNA樣轉(zhuǎn)錄本。后來(lái)的研究顯示,lncRNA具有與mRNA不同的獨(dú)特屬性。Chang教授通過(guò)這篇文章系統(tǒng)描述了lncRNA一生(轉(zhuǎn)錄前、轉(zhuǎn)錄中和轉(zhuǎn)錄后)中發(fā)生的特殊事件,探討了這些事件對(duì)lncRNA的塑造作用。
文章指出,在忙碌的一生中(從生物合成、成熟到降解),lncRNA受到的調(diào)控往往和mRNA并不相同。與mRNA相比,lncRNA會(huì)經(jīng)歷特殊的轉(zhuǎn)錄后加工,比如MALAT1和NEAT1。此外,很多lncRNA通過(guò)順式作用對(duì)旁邊的基因組位點(diǎn)進(jìn)行調(diào)控,其轉(zhuǎn)錄位置也很重要。