Cell發(fā)布基因組測序重要發(fā)現(xiàn)
日期：2015-08-17 08:41:28
一個國際研究小組報告稱他們建立了世界上最大的拉沙病毒（Lassa virus，LASV，埃博拉病毒的近親）數(shù)據(jù)集。這一新基因組目錄包含了從塞拉利昂和尼日利亞患者樣本，及主要的動物宿主多乳小鼠野外樣本中采集的近200個病毒基因組。
研究人員指出基于地理位置可將LASV病毒株可分為四大類，三種病毒株存在于尼日利亞，另一種存在于塞拉利昂、幾內(nèi)亞和利比里亞。盡管第一次描述拉沙熱是在1969年現(xiàn)代的尼日利亞，當(dāng)前的研究表明這四種LASV病毒株起源于1,000多年前一種共同的祖先病毒，其在過去的幾百年里傳遍了整個西非。這項研究發(fā)布在8月13日的《細(xì)胞》（Cell）雜志上。
論文的主要作者、斯克里普斯研究所（TSRI）生物學(xué)家Kristian G. Andersen說：“這讓我們清楚地了解了這一病毒的進(jìn)化過程，對于我們開發(fā)疫苗和治療方法極為重要。”
盡管拉沙熱通常病情輕微，這一疾病嚴(yán)重時會出現(xiàn)與埃博拉病相似的癥狀和體征。根據(jù)疾病控制與預(yù)防中心的統(tǒng)計，在西非每年大約有10萬—30萬拉沙熱病例，至少有5,000人死亡；在西非的某些地區(qū)10-16%的住院病例有可能是由于拉沙熱引起。當(dāng)前沒有針對拉沙熱的疫苗或治療方法，抗病毒藥物利巴韋林（ribavirin）可在疾病早期幫助到患者。拉沙病毒主要是通過人類與感染多乳小鼠（它是病毒的自然宿主）的尿液及糞便接觸而傳播，一般情況下很少通過直接的體液接觸在人和人之間傳播。
在這項新研究中，研究人員采用下一代測序技術(shù)分析了來自野生多乳小鼠和尼日利亞及塞拉利昂人類患者的拉沙病毒樣本的基因組。基因組數(shù)據(jù)顯示，廣泛分布的沙拉病毒具有共同的祖先，可追溯至1,000多年前今天稱作為尼日利亞的地區(qū)。這讓研究人員感到非常驚訝。Andersen說：“這一病毒有著非常悠久的歷史。”
研究人員說，病毒在大約400年前傳播到尼日利亞以外的地區(qū)，在過去的幾百年里遷移到了幾內(nèi)亞、利比里亞和塞拉利昂——自2013年以來最大規(guī)模的埃博拉疫情一直在這些地區(qū)持續(xù)。隨著拉沙病毒的傳播，其發(fā)生突變，似乎更好地適應(yīng)了哺乳動物宿主。
新數(shù)據(jù)也顯示，大多數(shù)拉沙熱病例都是從野生嚙齒動物宿主向人類頻繁的“外溢”感染所引起，而非人傳人。Andersen說：“拉沙沒有發(fā)展成巨大的流行病，就是因為人與人之間傳播受限。這是拉沙病毒和埃博拉病毒之間一個重要的區(qū)別。”
Andersen指出，西非當(dāng)?shù)氐目茖W(xué)家是這項新研究中的關(guān)鍵人物，也將在這一地區(qū)未來的研究中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。他認(rèn)為，研究的下一步是要了解病毒在個體宿主中面對免疫系統(tǒng)時的突變機(jī)制。
