個(gè)性化醫(yī)療技術(shù)幫助,使epigenomic分析只有100個(gè)細(xì)胞
日期：2015-07-31 11:33:58
一項(xiàng)新技術(shù),將大大提高調(diào)查的表觀基因組,打開和關(guān)閉基因的機(jī)器和一個(gè)非常重要的研究領(lǐng)域疾病的干細(xì)胞分化、炎癥和癌癥。
表觀基因組的考核需要映射在整個(gè)基因組DNA與某種相互作用蛋白質(zhì)。 這可能epigenomic特性允許醫(yī)生創(chuàng)建個(gè)性化治療的疾病,通過(guò)了解病人的狀態(tài),使預(yù)報(bào),并相應(yīng)調(diào)整治療策略。 然而,這樣的測(cè)試需要大量的 細(xì)胞 。 體內(nèi)全基因組的研究一度protein-DNA交互和染色質(zhì)的修改需要大約1000萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,一個(gè)單獨(dú)的測(cè)試。 這個(gè)巨大的需求幾乎排除這樣的患者樣本分析。
遠(yuǎn)超過(guò)十年,張陸,弗吉尼亞理工大學(xué)的化學(xué)工程教授一直從事開發(fā)工具來(lái)有效地分析活細(xì)胞的長(zhǎng)期目標(biāo),獲得更好的理解的一系列疾病。 在他的實(shí)驗(yàn)室里和他的學(xué)生發(fā)展小微流控設(shè)備,測(cè)微計(jì)特性研究細(xì)胞內(nèi)分子事件。
微流體是科學(xué)的一個(gè)分支,處理性能,控制和治療的液體以某種方式受到限制。
最新的突破來(lái)自陸與Kai Tan愛荷華大學(xué)的合作,系統(tǒng)生物學(xué)家和內(nèi)科醫(yī)學(xué)副教授。 在一起,他們證明了一種叫做基于微流體振蕩清洗染色質(zhì)免疫沉淀反應(yīng)(MOWChIP-Seq)允許分析epigenomic修改使用只有100個(gè)細(xì)胞。
美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院以及種子格蘭特從弗吉尼亞理工大學(xué)的關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用科學(xué)研究所資助的這項(xiàng)工作。
“使用填充床的珠子芯片允許我們收集的染色質(zhì)片段非常高的效率。 同時(shí),有效的清洗去除不想要的分子和碎片保證收集到的分子的純度。 這兩個(gè)因素構(gòu)成一個(gè)成功的戰(zhàn)略epigenomic分析和極高的靈敏度。
整個(gè)MOWChIP過(guò)程大約需要90分鐘,而不是幾個(gè)小時(shí),傳統(tǒng)芯片分析。
他們用他們的 技術(shù) 研究造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞的表觀基因組與小鼠的胎兒。
譚說(shuō):“是知之甚少的動(dòng)態(tài)表觀基因組在胚胎造血作用,很大程度上是由于很難隔離足夠數(shù)量的這些細(xì)胞發(fā)展embyros。 這種技術(shù)是完美的工具,用于解決這個(gè)問(wèn)題。”
”我們的技術(shù)為研究鋪平了道路與極低的表觀基因組的細(xì)胞數(shù)量從動(dòng)物和病人,”陸說(shuō)。 由幾個(gè)國(guó)家衛(wèi)生研究院資助,該小組計(jì)劃使用這一技術(shù)來(lái)研究其他epigenomic改變參與炎癥和癌癥在不久的將來(lái)。
弗吉尼亞理工大學(xué)知識(shí)產(chǎn)權(quán)提起了一個(gè)實(shí)用專利MOWChIP-Seq代表。
